Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0U9

Arv1, Protein ARV1, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arv1Q9D0U9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arv1Q9D0U9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arv1Q9D0U9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arv1Q9D0U9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arv1Q9D0U9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arv1Q9D0U9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arv1Q9D0U9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arv1Q9D0U9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arv1Q9D0U9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arv1Q9D0U9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arv1Q9D0U9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arv1Q9D0U9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arv1Q9D0U9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arv1Q9D0U9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arv1Q9D0U9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arv1Q9D0U9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arv1Q9D0U9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arv1Q9D0U9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arv1Q9D0U9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Arv1Q9D0U9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Arv1Q9D0U9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arv1Q9D0U9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arv1Q9D0U9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arv1Q9D0U9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arv1Q9D0U9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arv1Q9D0U9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Arv1Q9D0U9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Arv1Q9D0U9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arv1Q9D0U9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arv1Q9D0U9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arv1Q9D0U9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arv1Q9D0U9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arv1Q9D0U9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arv1Q9D0U9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arv1Q9D0U9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arv1Q9D0U9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arv1Q9D0U9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arv1Q9D0U9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arv1Q9D0U9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arv1Q9D0U9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arv1Q9D0U9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arv1Q9D0U9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arv1Q9D0U9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arv1Q9D0U9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Arv1Q9D0U9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Arv1Q9D0U9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arv1Q9D0U9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arv1Q9D0U9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arv1Q9D0U9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Arv1Q9D0U9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arv1Q9D0U9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arv1Q9D0U9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arv1Q9D0U9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arv1Q9D0U9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arv1Q9D0U9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arv1Q9D0U9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arv1Q9D0U9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arv1Q9D0U9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arv1Q9D0U9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arv1Q9D0U9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arv1Q9D0U9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arv1Q9D0U9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arv1Q9D0U9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arv1Q9D0U9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Arv1Q9D0U9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Arv1Q9D0U9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Arv1Q9D0U9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Arv1Q9D0U9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Arv1Q9D0U9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Arv1Q9D0U9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arv1Q9D0U9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arv1Q9D0U9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arv1Q9D0U9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arv1Q9D0U9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arv1Q9D0U9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arv1Q9D0U9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arv1Q9D0U9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arv1Q9D0U9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arv1Q9D0U9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arv1Q9D0U9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arv1Q9D0U9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Arv1Q9D0U9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arv1Q9D0U9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arv1Q9D0U9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arv1Q9D0U9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arv1Q9D0U9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arv1Q9D0U9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arv1Q9D0U9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arv1Q9D0U9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arv1Q9D0U9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arv1Q9D0U9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arv1Q9D0U9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arv1Q9D0U9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arv1Q9D0U9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arv1Q9D0U9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arv1Q9D0U9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arv1Q9D0U9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arv1Q9D0U9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arv1Q9D0U9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arv1Q9D0U9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms