Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ9

Dnajc18, DnaJ homolog subfamily C member 18, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc18Q9CZJ9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dnajc18Q9CZJ9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Dnajc18Q9CZJ9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dnajc18Q9CZJ9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dnajc18Q9CZJ9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dnajc18Q9CZJ9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dnajc18Q9CZJ9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dnajc18Q9CZJ9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dnajc18Q9CZJ9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dnajc18Q9CZJ9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dnajc18Q9CZJ9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Dnajc18Q9CZJ9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dnajc18Q9CZJ9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dnajc18Q9CZJ9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dnajc18Q9CZJ9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Dnajc18Q9CZJ9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dnajc18Q9CZJ9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dnajc18Q9CZJ9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dnajc18Q9CZJ9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dnajc18Q9CZJ9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dnajc18Q9CZJ9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Dnajc18Q9CZJ9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Dnajc18Q9CZJ9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Dnajc18Q9CZJ9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Dnajc18Q9CZJ9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Dnajc18Q9CZJ9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Dnajc18Q9CZJ9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Dnajc18Q9CZJ9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Dnajc18Q9CZJ9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Dnajc18Q9CZJ9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Dnajc18Q9CZJ9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dnajc18Q9CZJ9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dnajc18Q9CZJ9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dnajc18Q9CZJ9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dnajc18Q9CZJ9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dnajc18Q9CZJ9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dnajc18Q9CZJ9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dnajc18Q9CZJ9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dnajc18Q9CZJ9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dnajc18Q9CZJ9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dnajc18Q9CZJ9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dnajc18Q9CZJ9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dnajc18Q9CZJ9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dnajc18Q9CZJ9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dnajc18Q9CZJ9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dnajc18Q9CZJ9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dnajc18Q9CZJ9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dnajc18Q9CZJ9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dnajc18Q9CZJ9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dnajc18Q9CZJ9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dnajc18Q9CZJ9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dnajc18Q9CZJ9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dnajc18Q9CZJ9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dnajc18Q9CZJ9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dnajc18Q9CZJ9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Dnajc18Q9CZJ9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Dnajc18Q9CZJ9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Dnajc18Q9CZJ9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Dnajc18Q9CZJ9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Dnajc18Q9CZJ9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Dnajc18Q9CZJ9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Dnajc18Q9CZJ9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dnajc18Q9CZJ9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dnajc18Q9CZJ9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dnajc18Q9CZJ9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dnajc18Q9CZJ9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dnajc18Q9CZJ9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dnajc18Q9CZJ9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dnajc18Q9CZJ9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dnajc18Q9CZJ9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Dnajc18Q9CZJ9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Dnajc18Q9CZJ9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dnajc18Q9CZJ9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dnajc18Q9CZJ9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dnajc18Q9CZJ9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Dnajc18Q9CZJ9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dnajc18Q9CZJ9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dnajc18Q9CZJ9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dnajc18Q9CZJ9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dnajc18Q9CZJ9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dnajc18Q9CZJ9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dnajc18Q9CZJ9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dnajc18Q9CZJ9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dnajc18Q9CZJ9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dnajc18Q9CZJ9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dnajc18Q9CZJ9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Dnajc18Q9CZJ9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dnajc18Q9CZJ9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dnajc18Q9CZJ9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dnajc18Q9CZJ9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dnajc18Q9CZJ9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dnajc18Q9CZJ9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dnajc18Q9CZJ9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dnajc18Q9CZJ9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dnajc18Q9CZJ9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dnajc18Q9CZJ9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dnajc18Q9CZJ9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dnajc18Q9CZJ9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dnajc18Q9CZJ9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dnajc18Q9CZJ9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms