Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYI0

Protein Njmu-R1, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CYI0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Q9CYI0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Q9CYI0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Q9CYI0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Q9CYI0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Q9CYI0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q9CYI0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q9CYI0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q9CYI0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q9CYI0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q9CYI0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q9CYI0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q9CYI0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q9CYI0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q9CYI0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q9CYI0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q9CYI0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q9CYI0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q9CYI0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q9CYI0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q9CYI0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q9CYI0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q9CYI0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q9CYI0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q9CYI0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q9CYI0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q9CYI0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q9CYI0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q9CYI0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q9CYI0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q9CYI0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q9CYI0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q9CYI0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q9CYI0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q9CYI0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q9CYI0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Q9CYI0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q9CYI0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q9CYI0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q9CYI0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Q9CYI0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q9CYI0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q9CYI0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q9CYI0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q9CYI0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q9CYI0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q9CYI0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q9CYI0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q9CYI0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q9CYI0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q9CYI0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q9CYI0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q9CYI0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q9CYI0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q9CYI0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Q9CYI0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q9CYI0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q9CYI0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q9CYI0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q9CYI0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q9CYI0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q9CYI0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q9CYI0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q9CYI0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q9CYI0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q9CYI0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q9CYI0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q9CYI0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q9CYI0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q9CYI0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q9CYI0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q9CYI0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q9CYI0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q9CYI0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q9CYI0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q9CYI0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q9CYI0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q9CYI0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q9CYI0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q9CYI0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Q9CYI0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q9CYI0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Q9CYI0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q9CYI0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q9CYI0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q9CYI0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q9CYI0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q9CYI0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q9CYI0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q9CYI0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q9CYI0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q9CYI0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q9CYI0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q9CYI0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q9CYI0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Q9CYI0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q9CYI0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q9CYI0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q9CYI0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q9CYI0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms