Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXD9

Lrrc17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, mousemouse

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Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc17Q9CXD9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc17Q9CXD9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc17Q9CXD9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc17Q9CXD9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc17Q9CXD9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc17Q9CXD9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc17Q9CXD9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lrrc17Q9CXD9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lrrc17Q9CXD9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrc17Q9CXD9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrc17Q9CXD9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrc17Q9CXD9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc17Q9CXD9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc17Q9CXD9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc17Q9CXD9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc17Q9CXD9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc17Q9CXD9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc17Q9CXD9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc17Q9CXD9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc17Q9CXD9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc17Q9CXD9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc17Q9CXD9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc17Q9CXD9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc17Q9CXD9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc17Q9CXD9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc17Q9CXD9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc17Q9CXD9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc17Q9CXD9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc17Q9CXD9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc17Q9CXD9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc17Q9CXD9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc17Q9CXD9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc17Q9CXD9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc17Q9CXD9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc17Q9CXD9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc17Q9CXD9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc17Q9CXD9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc17Q9CXD9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc17Q9CXD9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc17Q9CXD9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc17Q9CXD9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc17Q9CXD9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc17Q9CXD9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc17Q9CXD9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc17Q9CXD9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc17Q9CXD9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc17Q9CXD9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc17Q9CXD9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc17Q9CXD9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc17Q9CXD9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc17Q9CXD9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc17Q9CXD9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc17Q9CXD9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc17Q9CXD9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc17Q9CXD9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc17Q9CXD9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc17Q9CXD9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc17Q9CXD9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc17Q9CXD9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc17Q9CXD9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc17Q9CXD9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc17Q9CXD9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc17Q9CXD9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc17Q9CXD9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc17Q9CXD9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc17Q9CXD9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc17Q9CXD9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc17Q9CXD9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc17Q9CXD9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc17Q9CXD9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrc17Q9CXD9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrc17Q9CXD9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrc17Q9CXD9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrc17Q9CXD9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrc17Q9CXD9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrc17Q9CXD9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrc17Q9CXD9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Lrrc17Q9CXD9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Lrrc17Q9CXD9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc17Q9CXD9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc17Q9CXD9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc17Q9CXD9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc17Q9CXD9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc17Q9CXD9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc17Q9CXD9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc17Q9CXD9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc17Q9CXD9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc17Q9CXD9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc17Q9CXD9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc17Q9CXD9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc17Q9CXD9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc17Q9CXD9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc17Q9CXD9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc17Q9CXD9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc17Q9CXD9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc17Q9CXD9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc17Q9CXD9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc17Q9CXD9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc17Q9CXD9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc17Q9CXD9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms