Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV0

Malsu1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Malsu1Q9CWV0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Malsu1Q9CWV0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Malsu1Q9CWV0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Malsu1Q9CWV0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Malsu1Q9CWV0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Malsu1Q9CWV0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Malsu1Q9CWV0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Malsu1Q9CWV0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Malsu1Q9CWV0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Malsu1Q9CWV0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Malsu1Q9CWV0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Malsu1Q9CWV0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Malsu1Q9CWV0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Malsu1Q9CWV0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Malsu1Q9CWV0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Malsu1Q9CWV0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Malsu1Q9CWV0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Malsu1Q9CWV0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Malsu1Q9CWV0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Malsu1Q9CWV0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Malsu1Q9CWV0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Malsu1Q9CWV0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Malsu1Q9CWV0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Malsu1Q9CWV0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Malsu1Q9CWV0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Malsu1Q9CWV0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Malsu1Q9CWV0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Malsu1Q9CWV0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Malsu1Q9CWV0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Malsu1Q9CWV0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Malsu1Q9CWV0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Malsu1Q9CWV0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Malsu1Q9CWV0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Malsu1Q9CWV0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Malsu1Q9CWV0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Malsu1Q9CWV0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Malsu1Q9CWV0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Malsu1Q9CWV0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Malsu1Q9CWV0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Malsu1Q9CWV0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Malsu1Q9CWV0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Malsu1Q9CWV0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Malsu1Q9CWV0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Malsu1Q9CWV0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Malsu1Q9CWV0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Malsu1Q9CWV0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Malsu1Q9CWV0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Malsu1Q9CWV0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Malsu1Q9CWV0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Malsu1Q9CWV0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Malsu1Q9CWV0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Malsu1Q9CWV0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Malsu1Q9CWV0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Malsu1Q9CWV0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Malsu1Q9CWV0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Malsu1Q9CWV0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Malsu1Q9CWV0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Malsu1Q9CWV0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Malsu1Q9CWV0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Malsu1Q9CWV0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Malsu1Q9CWV0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Malsu1Q9CWV0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Malsu1Q9CWV0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Malsu1Q9CWV0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Malsu1Q9CWV0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Malsu1Q9CWV0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Malsu1Q9CWV0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Malsu1Q9CWV0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Malsu1Q9CWV0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Malsu1Q9CWV0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Malsu1Q9CWV0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Malsu1Q9CWV0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Malsu1Q9CWV0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Malsu1Q9CWV0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Malsu1Q9CWV0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Malsu1Q9CWV0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Malsu1Q9CWV0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Malsu1Q9CWV0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Malsu1Q9CWV0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Malsu1Q9CWV0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Malsu1Q9CWV0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Malsu1Q9CWV0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Malsu1Q9CWV0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Malsu1Q9CWV0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Malsu1Q9CWV0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Malsu1Q9CWV0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Malsu1Q9CWV0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Malsu1Q9CWV0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Malsu1Q9CWV0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Malsu1Q9CWV0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Malsu1Q9CWV0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Malsu1Q9CWV0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Malsu1Q9CWV0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Malsu1Q9CWV0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Malsu1Q9CWV0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Malsu1Q9CWV0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Malsu1Q9CWV0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Malsu1Q9CWV0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Malsu1Q9CWV0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Malsu1Q9CWV0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms