Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU9

Nup37, Nucleoporin Nup37, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup37Q9CWU9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nup37Q9CWU9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nup37Q9CWU9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nup37Q9CWU9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nup37Q9CWU9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Nup37Q9CWU9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nup37Q9CWU9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nup37Q9CWU9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nup37Q9CWU9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nup37Q9CWU9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nup37Q9CWU9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nup37Q9CWU9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nup37Q9CWU9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nup37Q9CWU9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nup37Q9CWU9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nup37Q9CWU9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nup37Q9CWU9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nup37Q9CWU9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nup37Q9CWU9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nup37Q9CWU9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nup37Q9CWU9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nup37Q9CWU9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nup37Q9CWU9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nup37Q9CWU9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nup37Q9CWU9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nup37Q9CWU9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nup37Q9CWU9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nup37Q9CWU9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nup37Q9CWU9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nup37Q9CWU9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nup37Q9CWU9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nup37Q9CWU9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nup37Q9CWU9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nup37Q9CWU9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nup37Q9CWU9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nup37Q9CWU9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nup37Q9CWU9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nup37Q9CWU9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nup37Q9CWU9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nup37Q9CWU9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Nup37Q9CWU9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nup37Q9CWU9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nup37Q9CWU9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nup37Q9CWU9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nup37Q9CWU9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nup37Q9CWU9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nup37Q9CWU9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nup37Q9CWU9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nup37Q9CWU9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Nup37Q9CWU9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nup37Q9CWU9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nup37Q9CWU9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nup37Q9CWU9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nup37Q9CWU9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nup37Q9CWU9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nup37Q9CWU9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nup37Q9CWU9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nup37Q9CWU9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nup37Q9CWU9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nup37Q9CWU9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nup37Q9CWU9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nup37Q9CWU9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nup37Q9CWU9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nup37Q9CWU9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nup37Q9CWU9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nup37Q9CWU9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nup37Q9CWU9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nup37Q9CWU9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nup37Q9CWU9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Nup37Q9CWU9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nup37Q9CWU9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nup37Q9CWU9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nup37Q9CWU9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Nup37Q9CWU9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nup37Q9CWU9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nup37Q9CWU9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nup37Q9CWU9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nup37Q9CWU9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nup37Q9CWU9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nup37Q9CWU9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nup37Q9CWU9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nup37Q9CWU9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nup37Q9CWU9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Nup37Q9CWU9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nup37Q9CWU9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nup37Q9CWU9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nup37Q9CWU9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nup37Q9CWU9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nup37Q9CWU9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nup37Q9CWU9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nup37Q9CWU9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nup37Q9CWU9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nup37Q9CWU9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nup37Q9CWU9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nup37Q9CWU9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nup37Q9CWU9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nup37Q9CWU9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nup37Q9CWU9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nup37Q9CWU9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nup37Q9CWU9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms