Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWK8

Snx2, Sorting nexin-2, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx2Q9CWK8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx2Q9CWK8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx2Q9CWK8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx2Q9CWK8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx2Q9CWK8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx2Q9CWK8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx2Q9CWK8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx2Q9CWK8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx2Q9CWK8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx2Q9CWK8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx2Q9CWK8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx2Q9CWK8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx2Q9CWK8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx2Q9CWK8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx2Q9CWK8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx2Q9CWK8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx2Q9CWK8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx2Q9CWK8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx2Q9CWK8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx2Q9CWK8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx2Q9CWK8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx2Q9CWK8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx2Q9CWK8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx2Q9CWK8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx2Q9CWK8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx2Q9CWK8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx2Q9CWK8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx2Q9CWK8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx2Q9CWK8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx2Q9CWK8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snx2Q9CWK8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Snx2Q9CWK8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snx2Q9CWK8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snx2Q9CWK8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snx2Q9CWK8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snx2Q9CWK8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snx2Q9CWK8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snx2Q9CWK8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Snx2Q9CWK8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Snx2Q9CWK8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snx2Q9CWK8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snx2Q9CWK8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Snx2Q9CWK8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snx2Q9CWK8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snx2Q9CWK8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Snx2Q9CWK8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snx2Q9CWK8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snx2Q9CWK8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snx2Q9CWK8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snx2Q9CWK8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snx2Q9CWK8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Snx2Q9CWK8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Snx2Q9CWK8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snx2Q9CWK8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snx2Q9CWK8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snx2Q9CWK8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snx2Q9CWK8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snx2Q9CWK8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Snx2Q9CWK8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snx2Q9CWK8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Snx2Q9CWK8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snx2Q9CWK8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Snx2Q9CWK8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snx2Q9CWK8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Snx2Q9CWK8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Snx2Q9CWK8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx2Q9CWK8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Snx2Q9CWK8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Snx2Q9CWK8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx2Q9CWK8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx2Q9CWK8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx2Q9CWK8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snx2Q9CWK8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snx2Q9CWK8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snx2Q9CWK8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snx2Q9CWK8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snx2Q9CWK8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snx2Q9CWK8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Snx2Q9CWK8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Snx2Q9CWK8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Snx2Q9CWK8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx2Q9CWK8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx2Q9CWK8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx2Q9CWK8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx2Q9CWK8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx2Q9CWK8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx2Q9CWK8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx2Q9CWK8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx2Q9CWK8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx2Q9CWK8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx2Q9CWK8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx2Q9CWK8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx2Q9CWK8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx2Q9CWK8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx2Q9CWK8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx2Q9CWK8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx2Q9CWK8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx2Q9CWK8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx2Q9CWK8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx2Q9CWK8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 177.3 ms