Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Otud1Q9CUB6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Otud1Q9CUB6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Otud1Q9CUB6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Otud1Q9CUB6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Otud1Q9CUB6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Otud1Q9CUB6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Otud1Q9CUB6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Otud1Q9CUB6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Otud1Q9CUB6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Otud1Q9CUB6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Otud1Q9CUB6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Otud1Q9CUB6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Otud1Q9CUB6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Otud1Q9CUB6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Otud1Q9CUB6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Otud1Q9CUB6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Otud1Q9CUB6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Otud1Q9CUB6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Otud1Q9CUB6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Otud1Q9CUB6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Otud1Q9CUB6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Otud1Q9CUB6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Otud1Q9CUB6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Otud1Q9CUB6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Otud1Q9CUB6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Otud1Q9CUB6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Otud1Q9CUB6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Otud1Q9CUB6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Otud1Q9CUB6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Otud1Q9CUB6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Otud1Q9CUB6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Otud1Q9CUB6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Otud1Q9CUB6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Otud1Q9CUB6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Otud1Q9CUB6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Otud1Q9CUB6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Otud1Q9CUB6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Otud1Q9CUB6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Otud1Q9CUB6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Otud1Q9CUB6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Otud1Q9CUB6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Otud1Q9CUB6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Otud1Q9CUB6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Otud1Q9CUB6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Otud1Q9CUB6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Otud1Q9CUB6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Otud1Q9CUB6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Otud1Q9CUB6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Otud1Q9CUB6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Otud1Q9CUB6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Otud1Q9CUB6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Otud1Q9CUB6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Otud1Q9CUB6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Otud1Q9CUB6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Otud1Q9CUB6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Otud1Q9CUB6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Otud1Q9CUB6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Otud1Q9CUB6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Otud1Q9CUB6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Otud1Q9CUB6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Otud1Q9CUB6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Otud1Q9CUB6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Otud1Q9CUB6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Otud1Q9CUB6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Otud1Q9CUB6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Otud1Q9CUB6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Otud1Q9CUB6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Otud1Q9CUB6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Otud1Q9CUB6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Otud1Q9CUB6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Otud1Q9CUB6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Otud1Q9CUB6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Otud1Q9CUB6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Otud1Q9CUB6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Otud1Q9CUB6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Otud1Q9CUB6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Otud1Q9CUB6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Otud1Q9CUB6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Otud1Q9CUB6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Otud1Q9CUB6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Otud1Q9CUB6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Otud1Q9CUB6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Otud1Q9CUB6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Otud1Q9CUB6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Otud1Q9CUB6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Otud1Q9CUB6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Otud1Q9CUB6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Otud1Q9CUB6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Otud1Q9CUB6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Otud1Q9CUB6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Otud1Q9CUB6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Otud1Q9CUB6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Otud1Q9CUB6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Otud1Q9CUB6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Otud1Q9CUB6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Otud1Q9CUB6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Otud1Q9CUB6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Otud1Q9CUB6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Otud1Q9CUB6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms