Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lhfpl3Q9CTN8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lhfpl3Q9CTN8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lhfpl3Q9CTN8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lhfpl3Q9CTN8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lhfpl3Q9CTN8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms