Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl35Q9CQL6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl35Q9CQL6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl35Q9CQL6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl35Q9CQL6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl35Q9CQL6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl35Q9CQL6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl35Q9CQL6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl35Q9CQL6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl35Q9CQL6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl35Q9CQL6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl35Q9CQL6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl35Q9CQL6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl35Q9CQL6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl35Q9CQL6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl35Q9CQL6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl35Q9CQL6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl35Q9CQL6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl35Q9CQL6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl35Q9CQL6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl35Q9CQL6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl35Q9CQL6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl35Q9CQL6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl35Q9CQL6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl35Q9CQL6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl35Q9CQL6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl35Q9CQL6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl35Q9CQL6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl35Q9CQL6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl35Q9CQL6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl35Q9CQL6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl35Q9CQL6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl35Q9CQL6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl35Q9CQL6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl35Q9CQL6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl35Q9CQL6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl35Q9CQL6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl35Q9CQL6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl35Q9CQL6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl35Q9CQL6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl35Q9CQL6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl35Q9CQL6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl35Q9CQL6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl35Q9CQL6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl35Q9CQL6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl35Q9CQL6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl35Q9CQL6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl35Q9CQL6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl35Q9CQL6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl35Q9CQL6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl35Q9CQL6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl35Q9CQL6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl35Q9CQL6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl35Q9CQL6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl35Q9CQL6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl35Q9CQL6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl35Q9CQL6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl35Q9CQL6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl35Q9CQL6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl35Q9CQL6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl35Q9CQL6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl35Q9CQL6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl35Q9CQL6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl35Q9CQL6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl35Q9CQL6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl35Q9CQL6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl35Q9CQL6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl35Q9CQL6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl35Q9CQL6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl35Q9CQL6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl35Q9CQL6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl35Q9CQL6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl35Q9CQL6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl35Q9CQL6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl35Q9CQL6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl35Q9CQL6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl35Q9CQL6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl35Q9CQL6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl35Q9CQL6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl35Q9CQL6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl35Q9CQL6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl35Q9CQL6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl35Q9CQL6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl35Q9CQL6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl35Q9CQL6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl35Q9CQL6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl35Q9CQL6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl35Q9CQL6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl35Q9CQL6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl35Q9CQL6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl35Q9CQL6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl35Q9CQL6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl35Q9CQL6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl35Q9CQL6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl35Q9CQL6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl35Q9CQL6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl35Q9CQL6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl35Q9CQL6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl35Q9CQL6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl35Q9CQL6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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