Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nipsnap3bQ9CQE1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nipsnap3bQ9CQE1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nipsnap3bQ9CQE1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nipsnap3bQ9CQE1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nipsnap3bQ9CQE1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nipsnap3bQ9CQE1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nipsnap3bQ9CQE1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nipsnap3bQ9CQE1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Nipsnap3bQ9CQE1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nipsnap3bQ9CQE1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nipsnap3bQ9CQE1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nipsnap3bQ9CQE1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nipsnap3bQ9CQE1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nipsnap3bQ9CQE1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nipsnap3bQ9CQE1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nipsnap3bQ9CQE1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nipsnap3bQ9CQE1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nipsnap3bQ9CQE1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nipsnap3bQ9CQE1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nipsnap3bQ9CQE1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nipsnap3bQ9CQE1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nipsnap3bQ9CQE1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nipsnap3bQ9CQE1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nipsnap3bQ9CQE1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Nipsnap3bQ9CQE1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Nipsnap3bQ9CQE1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nipsnap3bQ9CQE1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nipsnap3bQ9CQE1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nipsnap3bQ9CQE1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nipsnap3bQ9CQE1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nipsnap3bQ9CQE1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nipsnap3bQ9CQE1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nipsnap3bQ9CQE1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nipsnap3bQ9CQE1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nipsnap3bQ9CQE1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nipsnap3bQ9CQE1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nipsnap3bQ9CQE1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nipsnap3bQ9CQE1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Nipsnap3bQ9CQE1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nipsnap3bQ9CQE1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nipsnap3bQ9CQE1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nipsnap3bQ9CQE1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nipsnap3bQ9CQE1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nipsnap3bQ9CQE1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nipsnap3bQ9CQE1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nipsnap3bQ9CQE1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nipsnap3bQ9CQE1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nipsnap3bQ9CQE1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Nipsnap3bQ9CQE1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nipsnap3bQ9CQE1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Nipsnap3bQ9CQE1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Nipsnap3bQ9CQE1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Nipsnap3bQ9CQE1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nipsnap3bQ9CQE1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nipsnap3bQ9CQE1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nipsnap3bQ9CQE1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nipsnap3bQ9CQE1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nipsnap3bQ9CQE1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nipsnap3bQ9CQE1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nipsnap3bQ9CQE1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nipsnap3bQ9CQE1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nipsnap3bQ9CQE1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nipsnap3bQ9CQE1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Nipsnap3bQ9CQE1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nipsnap3bQ9CQE1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nipsnap3bQ9CQE1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nipsnap3bQ9CQE1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nipsnap3bQ9CQE1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nipsnap3bQ9CQE1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nipsnap3bQ9CQE1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nipsnap3bQ9CQE1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nipsnap3bQ9CQE1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nipsnap3bQ9CQE1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nipsnap3bQ9CQE1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nipsnap3bQ9CQE1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nipsnap3bQ9CQE1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nipsnap3bQ9CQE1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nipsnap3bQ9CQE1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nipsnap3bQ9CQE1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms