Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA6

Chchd1, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd1Q9CQA6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chchd1Q9CQA6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chchd1Q9CQA6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chchd1Q9CQA6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chchd1Q9CQA6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chchd1Q9CQA6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chchd1Q9CQA6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chchd1Q9CQA6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chchd1Q9CQA6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Chchd1Q9CQA6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chchd1Q9CQA6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chchd1Q9CQA6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chchd1Q9CQA6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chchd1Q9CQA6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chchd1Q9CQA6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chchd1Q9CQA6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chchd1Q9CQA6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Chchd1Q9CQA6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chchd1Q9CQA6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Chchd1Q9CQA6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chchd1Q9CQA6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chchd1Q9CQA6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chchd1Q9CQA6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chchd1Q9CQA6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chchd1Q9CQA6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chchd1Q9CQA6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chchd1Q9CQA6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chchd1Q9CQA6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chchd1Q9CQA6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chchd1Q9CQA6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chchd1Q9CQA6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chchd1Q9CQA6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chchd1Q9CQA6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chchd1Q9CQA6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Chchd1Q9CQA6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chchd1Q9CQA6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chchd1Q9CQA6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chchd1Q9CQA6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chchd1Q9CQA6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chchd1Q9CQA6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chchd1Q9CQA6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chchd1Q9CQA6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chchd1Q9CQA6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chchd1Q9CQA6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chchd1Q9CQA6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chchd1Q9CQA6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chchd1Q9CQA6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chchd1Q9CQA6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chchd1Q9CQA6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chchd1Q9CQA6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chchd1Q9CQA6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Chchd1Q9CQA6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chchd1Q9CQA6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chchd1Q9CQA6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chchd1Q9CQA6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chchd1Q9CQA6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chchd1Q9CQA6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chchd1Q9CQA6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chchd1Q9CQA6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chchd1Q9CQA6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chchd1Q9CQA6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chchd1Q9CQA6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chchd1Q9CQA6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chchd1Q9CQA6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chchd1Q9CQA6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chchd1Q9CQA6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chchd1Q9CQA6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chchd1Q9CQA6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chchd1Q9CQA6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chchd1Q9CQA6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chchd1Q9CQA6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chchd1Q9CQA6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chchd1Q9CQA6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chchd1Q9CQA6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chchd1Q9CQA6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chchd1Q9CQA6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chchd1Q9CQA6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chchd1Q9CQA6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chchd1Q9CQA6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chchd1Q9CQA6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chchd1Q9CQA6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chchd1Q9CQA6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chchd1Q9CQA6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Chchd1Q9CQA6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chchd1Q9CQA6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chchd1Q9CQA6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chchd1Q9CQA6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chchd1Q9CQA6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chchd1Q9CQA6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chchd1Q9CQA6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chchd1Q9CQA6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chchd1Q9CQA6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chchd1Q9CQA6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chchd1Q9CQA6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chchd1Q9CQA6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chchd1Q9CQA6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chchd1Q9CQA6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chchd1Q9CQA6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chchd1Q9CQA6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chchd1Q9CQA6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.4 ms