Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ48

Nudcd2, NudC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd2Q9CQ48 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nudcd2Q9CQ48 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nudcd2Q9CQ48 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nudcd2Q9CQ48 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nudcd2Q9CQ48 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nudcd2Q9CQ48 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nudcd2Q9CQ48 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nudcd2Q9CQ48 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nudcd2Q9CQ48 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Nudcd2Q9CQ48 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nudcd2Q9CQ48 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nudcd2Q9CQ48 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nudcd2Q9CQ48 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nudcd2Q9CQ48 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nudcd2Q9CQ48 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nudcd2Q9CQ48 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nudcd2Q9CQ48 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nudcd2Q9CQ48 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nudcd2Q9CQ48 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nudcd2Q9CQ48 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nudcd2Q9CQ48 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nudcd2Q9CQ48 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Nudcd2Q9CQ48 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nudcd2Q9CQ48 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nudcd2Q9CQ48 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Nudcd2Q9CQ48 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nudcd2Q9CQ48 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nudcd2Q9CQ48 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nudcd2Q9CQ48 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Nudcd2Q9CQ48 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nudcd2Q9CQ48 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nudcd2Q9CQ48 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nudcd2Q9CQ48 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nudcd2Q9CQ48 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nudcd2Q9CQ48 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Nudcd2Q9CQ48 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nudcd2Q9CQ48 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nudcd2Q9CQ48 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nudcd2Q9CQ48 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nudcd2Q9CQ48 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nudcd2Q9CQ48 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nudcd2Q9CQ48 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nudcd2Q9CQ48 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nudcd2Q9CQ48 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nudcd2Q9CQ48 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nudcd2Q9CQ48 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nudcd2Q9CQ48 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nudcd2Q9CQ48 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nudcd2Q9CQ48 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nudcd2Q9CQ48 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nudcd2Q9CQ48 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nudcd2Q9CQ48 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nudcd2Q9CQ48 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nudcd2Q9CQ48 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nudcd2Q9CQ48 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nudcd2Q9CQ48 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nudcd2Q9CQ48 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nudcd2Q9CQ48 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Nudcd2Q9CQ48 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nudcd2Q9CQ48 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nudcd2Q9CQ48 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nudcd2Q9CQ48 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nudcd2Q9CQ48 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nudcd2Q9CQ48 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nudcd2Q9CQ48 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nudcd2Q9CQ48 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nudcd2Q9CQ48 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nudcd2Q9CQ48 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nudcd2Q9CQ48 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nudcd2Q9CQ48 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nudcd2Q9CQ48 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nudcd2Q9CQ48 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nudcd2Q9CQ48 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nudcd2Q9CQ48 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nudcd2Q9CQ48 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nudcd2Q9CQ48 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nudcd2Q9CQ48 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nudcd2Q9CQ48 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nudcd2Q9CQ48 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nudcd2Q9CQ48 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nudcd2Q9CQ48 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nudcd2Q9CQ48 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nudcd2Q9CQ48 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nudcd2Q9CQ48 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nudcd2Q9CQ48 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nudcd2Q9CQ48 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nudcd2Q9CQ48 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nudcd2Q9CQ48 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nudcd2Q9CQ48 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nudcd2Q9CQ48 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nudcd2Q9CQ48 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nudcd2Q9CQ48 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nudcd2Q9CQ48 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nudcd2Q9CQ48 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nudcd2Q9CQ48 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nudcd2Q9CQ48 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nudcd2Q9CQ48 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nudcd2Q9CQ48 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nudcd2Q9CQ48 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nudcd2Q9CQ48 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms