Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
StambpQ9CQ26 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
StambpQ9CQ26 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
StambpQ9CQ26 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
StambpQ9CQ26 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
StambpQ9CQ26 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
StambpQ9CQ26 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
StambpQ9CQ26 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
StambpQ9CQ26 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
StambpQ9CQ26 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
StambpQ9CQ26 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
StambpQ9CQ26 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
StambpQ9CQ26 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
StambpQ9CQ26 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
StambpQ9CQ26 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
StambpQ9CQ26 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
StambpQ9CQ26 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
StambpQ9CQ26 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
StambpQ9CQ26 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
StambpQ9CQ26 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
StambpQ9CQ26 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
StambpQ9CQ26 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
StambpQ9CQ26 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
StambpQ9CQ26 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
StambpQ9CQ26 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
StambpQ9CQ26 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
StambpQ9CQ26 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
StambpQ9CQ26 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
StambpQ9CQ26 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
StambpQ9CQ26 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
StambpQ9CQ26 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
StambpQ9CQ26 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
StambpQ9CQ26 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
StambpQ9CQ26 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
StambpQ9CQ26 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
StambpQ9CQ26 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
StambpQ9CQ26 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
StambpQ9CQ26 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
StambpQ9CQ26 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
StambpQ9CQ26 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
StambpQ9CQ26 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
StambpQ9CQ26 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
StambpQ9CQ26 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
StambpQ9CQ26 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
StambpQ9CQ26 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
StambpQ9CQ26 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
StambpQ9CQ26 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
StambpQ9CQ26 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
StambpQ9CQ26 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
StambpQ9CQ26 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
StambpQ9CQ26 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
StambpQ9CQ26 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
StambpQ9CQ26 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
StambpQ9CQ26 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
StambpQ9CQ26 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
StambpQ9CQ26 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
StambpQ9CQ26 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
StambpQ9CQ26 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
StambpQ9CQ26 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
StambpQ9CQ26 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
StambpQ9CQ26 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
StambpQ9CQ26 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
StambpQ9CQ26 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
StambpQ9CQ26 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
StambpQ9CQ26 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
StambpQ9CQ26 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
StambpQ9CQ26 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
StambpQ9CQ26 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
StambpQ9CQ26 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
StambpQ9CQ26 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
StambpQ9CQ26 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
StambpQ9CQ26 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
StambpQ9CQ26 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
StambpQ9CQ26 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
StambpQ9CQ26 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
StambpQ9CQ26 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
StambpQ9CQ26 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
StambpQ9CQ26 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
StambpQ9CQ26 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
StambpQ9CQ26 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
StambpQ9CQ26 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
StambpQ9CQ26 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
StambpQ9CQ26 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
StambpQ9CQ26 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
StambpQ9CQ26 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
StambpQ9CQ26 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
StambpQ9CQ26 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
StambpQ9CQ26 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
StambpQ9CQ26 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
StambpQ9CQ26 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
StambpQ9CQ26 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
StambpQ9CQ26 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
StambpQ9CQ26 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
StambpQ9CQ26 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
StambpQ9CQ26 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
StambpQ9CQ26 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
StambpQ9CQ26 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
StambpQ9CQ26 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
StambpQ9CQ26 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
StambpQ9CQ26 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms