Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
StambpQ9CQ26 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
StambpQ9CQ26 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
StambpQ9CQ26 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
StambpQ9CQ26 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
StambpQ9CQ26 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
StambpQ9CQ26 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
StambpQ9CQ26 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
StambpQ9CQ26 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
StambpQ9CQ26 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
StambpQ9CQ26 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
StambpQ9CQ26 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
StambpQ9CQ26 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
StambpQ9CQ26 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
StambpQ9CQ26 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
StambpQ9CQ26 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
StambpQ9CQ26 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
StambpQ9CQ26 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
StambpQ9CQ26 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
StambpQ9CQ26 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
StambpQ9CQ26 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
StambpQ9CQ26 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
StambpQ9CQ26 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
StambpQ9CQ26 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
StambpQ9CQ26 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
StambpQ9CQ26 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
StambpQ9CQ26 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
StambpQ9CQ26 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
StambpQ9CQ26 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
StambpQ9CQ26 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
StambpQ9CQ26 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
StambpQ9CQ26 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
StambpQ9CQ26 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
StambpQ9CQ26 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
StambpQ9CQ26 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
StambpQ9CQ26 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
StambpQ9CQ26 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
StambpQ9CQ26 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
StambpQ9CQ26 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
StambpQ9CQ26 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
StambpQ9CQ26 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
StambpQ9CQ26 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
StambpQ9CQ26 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
StambpQ9CQ26 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
StambpQ9CQ26 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
StambpQ9CQ26 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
StambpQ9CQ26 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
StambpQ9CQ26 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
StambpQ9CQ26 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
StambpQ9CQ26 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
StambpQ9CQ26 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
StambpQ9CQ26 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
StambpQ9CQ26 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
StambpQ9CQ26 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
StambpQ9CQ26 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
StambpQ9CQ26 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
StambpQ9CQ26 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
StambpQ9CQ26 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
StambpQ9CQ26 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
StambpQ9CQ26 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
StambpQ9CQ26 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
StambpQ9CQ26 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
StambpQ9CQ26 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
StambpQ9CQ26 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
StambpQ9CQ26 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
StambpQ9CQ26 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
StambpQ9CQ26 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
StambpQ9CQ26 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
StambpQ9CQ26 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
StambpQ9CQ26 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
StambpQ9CQ26 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
StambpQ9CQ26 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
StambpQ9CQ26 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
StambpQ9CQ26 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
StambpQ9CQ26 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
StambpQ9CQ26 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
StambpQ9CQ26 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
StambpQ9CQ26 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
StambpQ9CQ26 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
StambpQ9CQ26 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
StambpQ9CQ26 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
StambpQ9CQ26 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
StambpQ9CQ26 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
StambpQ9CQ26 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
StambpQ9CQ26 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
StambpQ9CQ26 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
StambpQ9CQ26 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
StambpQ9CQ26 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
StambpQ9CQ26 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
StambpQ9CQ26 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
StambpQ9CQ26 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
StambpQ9CQ26 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
StambpQ9CQ26 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
StambpQ9CQ26 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
StambpQ9CQ26 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
StambpQ9CQ26 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
StambpQ9CQ26 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
StambpQ9CQ26 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
StambpQ9CQ26 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
StambpQ9CQ26 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms