Protein–RNA interactions for Protein: Q99NG0

Rad54l2, Helicase ARIP4, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54l2Q99NG0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Rad54l2Q99NG0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Rad54l2Q99NG0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Rad54l2Q99NG0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Rad54l2Q99NG0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Rad54l2Q99NG0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Rad54l2Q99NG0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Rad54l2Q99NG0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Rad54l2Q99NG0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Rad54l2Q99NG0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Rad54l2Q99NG0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Rad54l2Q99NG0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Rad54l2Q99NG0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
Rad54l2Q99NG0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Rad54l2Q99NG0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Rad54l2Q99NG0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Rad54l2Q99NG0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Rad54l2Q99NG0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Rad54l2Q99NG0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Rad54l2Q99NG0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Rad54l2Q99NG0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Rad54l2Q99NG0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Rad54l2Q99NG0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
Rad54l2Q99NG0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Rad54l2Q99NG0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Rad54l2Q99NG0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Rad54l2Q99NG0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Rad54l2Q99NG0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Rad54l2Q99NG0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Rad54l2Q99NG0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Rad54l2Q99NG0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Rad54l2Q99NG0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Rad54l2Q99NG0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Rad54l2Q99NG0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Rad54l2Q99NG0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Rad54l2Q99NG0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
Rad54l2Q99NG0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Rad54l2Q99NG0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Rad54l2Q99NG0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Rad54l2Q99NG0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Rad54l2Q99NG0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Rad54l2Q99NG0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
Rad54l2Q99NG0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Rad54l2Q99NG0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Rad54l2Q99NG0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Rad54l2Q99NG0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Rad54l2Q99NG0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Rad54l2Q99NG0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Rad54l2Q99NG0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Rad54l2Q99NG0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Rad54l2Q99NG0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Rad54l2Q99NG0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Rad54l2Q99NG0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
Rad54l2Q99NG0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Rad54l2Q99NG0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Rad54l2Q99NG0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Rad54l2Q99NG0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Rad54l2Q99NG0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Rad54l2Q99NG0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Rad54l2Q99NG0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Rad54l2Q99NG0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Rad54l2Q99NG0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Rad54l2Q99NG0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Rad54l2Q99NG0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
Rad54l2Q99NG0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Rad54l2Q99NG0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Rad54l2Q99NG0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Rad54l2Q99NG0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Rad54l2Q99NG0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Rad54l2Q99NG0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Rad54l2Q99NG0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Rad54l2Q99NG0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Rad54l2Q99NG0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Rad54l2Q99NG0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Rad54l2Q99NG0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Rad54l2Q99NG0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Rad54l2Q99NG0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Rad54l2Q99NG0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Rad54l2Q99NG0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Rad54l2Q99NG0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Rad54l2Q99NG0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Rad54l2Q99NG0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Rad54l2Q99NG0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Rad54l2Q99NG0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Rad54l2Q99NG0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
Rad54l2Q99NG0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Rad54l2Q99NG0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Rad54l2Q99NG0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Rad54l2Q99NG0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Rad54l2Q99NG0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Rad54l2Q99NG0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Rad54l2Q99NG0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Rad54l2Q99NG0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Rad54l2Q99NG0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Rad54l2Q99NG0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Rad54l2Q99NG0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Rad54l2Q99NG0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Rad54l2Q99NG0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Rad54l2Q99NG0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Rad54l2Q99NG0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms