Protein–RNA interactions for Protein: Q99M87

Dnaja3, DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaja3Q99M87 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Dnaja3Q99M87 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Dnaja3Q99M87 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Dnaja3Q99M87 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Dnaja3Q99M87 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Dnaja3Q99M87 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Dnaja3Q99M87 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Dnaja3Q99M87 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Dnaja3Q99M87 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Dnaja3Q99M87 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Dnaja3Q99M87 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Dnaja3Q99M87 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Dnaja3Q99M87 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Dnaja3Q99M87 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dnaja3Q99M87 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dnaja3Q99M87 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dnaja3Q99M87 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Dnaja3Q99M87 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dnaja3Q99M87 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dnaja3Q99M87 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dnaja3Q99M87 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dnaja3Q99M87 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dnaja3Q99M87 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dnaja3Q99M87 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dnaja3Q99M87 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dnaja3Q99M87 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dnaja3Q99M87 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dnaja3Q99M87 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dnaja3Q99M87 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dnaja3Q99M87 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dnaja3Q99M87 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dnaja3Q99M87 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dnaja3Q99M87 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dnaja3Q99M87 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dnaja3Q99M87 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dnaja3Q99M87 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dnaja3Q99M87 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dnaja3Q99M87 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dnaja3Q99M87 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dnaja3Q99M87 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dnaja3Q99M87 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dnaja3Q99M87 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dnaja3Q99M87 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dnaja3Q99M87 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dnaja3Q99M87 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dnaja3Q99M87 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dnaja3Q99M87 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dnaja3Q99M87 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dnaja3Q99M87 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dnaja3Q99M87 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dnaja3Q99M87 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Dnaja3Q99M87 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dnaja3Q99M87 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dnaja3Q99M87 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dnaja3Q99M87 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dnaja3Q99M87 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dnaja3Q99M87 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dnaja3Q99M87 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dnaja3Q99M87 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dnaja3Q99M87 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dnaja3Q99M87 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dnaja3Q99M87 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dnaja3Q99M87 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dnaja3Q99M87 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dnaja3Q99M87 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dnaja3Q99M87 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dnaja3Q99M87 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dnaja3Q99M87 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dnaja3Q99M87 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dnaja3Q99M87 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dnaja3Q99M87 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dnaja3Q99M87 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dnaja3Q99M87 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dnaja3Q99M87 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dnaja3Q99M87 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dnaja3Q99M87 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dnaja3Q99M87 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dnaja3Q99M87 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dnaja3Q99M87 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dnaja3Q99M87 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dnaja3Q99M87 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dnaja3Q99M87 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dnaja3Q99M87 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dnaja3Q99M87 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dnaja3Q99M87 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dnaja3Q99M87 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dnaja3Q99M87 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dnaja3Q99M87 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dnaja3Q99M87 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dnaja3Q99M87 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dnaja3Q99M87 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dnaja3Q99M87 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dnaja3Q99M87 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dnaja3Q99M87 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dnaja3Q99M87 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dnaja3Q99M87 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dnaja3Q99M87 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dnaja3Q99M87 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dnaja3Q99M87 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dnaja3Q99M87 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.6 ms