Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp1b1Q99LU0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp1b1Q99LU0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp1b1Q99LU0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp1b1Q99LU0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp1b1Q99LU0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp1b1Q99LU0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp1b1Q99LU0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp1b1Q99LU0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp1b1Q99LU0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp1b1Q99LU0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp1b1Q99LU0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp1b1Q99LU0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp1b1Q99LU0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp1b1Q99LU0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp1b1Q99LU0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp1b1Q99LU0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp1b1Q99LU0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp1b1Q99LU0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp1b1Q99LU0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp1b1Q99LU0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp1b1Q99LU0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp1b1Q99LU0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp1b1Q99LU0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp1b1Q99LU0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp1b1Q99LU0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp1b1Q99LU0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp1b1Q99LU0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chmp1b1Q99LU0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chmp1b1Q99LU0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chmp1b1Q99LU0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chmp1b1Q99LU0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chmp1b1Q99LU0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chmp1b1Q99LU0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chmp1b1Q99LU0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chmp1b1Q99LU0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chmp1b1Q99LU0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chmp1b1Q99LU0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chmp1b1Q99LU0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chmp1b1Q99LU0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chmp1b1Q99LU0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chmp1b1Q99LU0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chmp1b1Q99LU0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chmp1b1Q99LU0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chmp1b1Q99LU0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chmp1b1Q99LU0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chmp1b1Q99LU0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chmp1b1Q99LU0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chmp1b1Q99LU0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chmp1b1Q99LU0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chmp1b1Q99LU0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chmp1b1Q99LU0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chmp1b1Q99LU0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chmp1b1Q99LU0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chmp1b1Q99LU0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chmp1b1Q99LU0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chmp1b1Q99LU0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chmp1b1Q99LU0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chmp1b1Q99LU0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chmp1b1Q99LU0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chmp1b1Q99LU0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chmp1b1Q99LU0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chmp1b1Q99LU0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chmp1b1Q99LU0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chmp1b1Q99LU0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chmp1b1Q99LU0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chmp1b1Q99LU0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chmp1b1Q99LU0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chmp1b1Q99LU0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chmp1b1Q99LU0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chmp1b1Q99LU0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chmp1b1Q99LU0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chmp1b1Q99LU0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chmp1b1Q99LU0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chmp1b1Q99LU0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chmp1b1Q99LU0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chmp1b1Q99LU0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Chmp1b1Q99LU0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Chmp1b1Q99LU0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Chmp1b1Q99LU0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chmp1b1Q99LU0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chmp1b1Q99LU0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chmp1b1Q99LU0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chmp1b1Q99LU0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chmp1b1Q99LU0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chmp1b1Q99LU0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chmp1b1Q99LU0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chmp1b1Q99LU0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Chmp1b1Q99LU0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Chmp1b1Q99LU0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Chmp1b1Q99LU0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Chmp1b1Q99LU0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Chmp1b1Q99LU0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Chmp1b1Q99LU0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Chmp1b1Q99LU0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Chmp1b1Q99LU0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chmp1b1Q99LU0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chmp1b1Q99LU0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chmp1b1Q99LU0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chmp1b1Q99LU0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms