Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Usp16Q99LG0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Usp16Q99LG0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Usp16Q99LG0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Usp16Q99LG0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Usp16Q99LG0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Usp16Q99LG0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Usp16Q99LG0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Usp16Q99LG0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Usp16Q99LG0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Usp16Q99LG0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Usp16Q99LG0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Usp16Q99LG0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Usp16Q99LG0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Usp16Q99LG0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Usp16Q99LG0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Usp16Q99LG0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Usp16Q99LG0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Usp16Q99LG0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Usp16Q99LG0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Usp16Q99LG0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Usp16Q99LG0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Usp16Q99LG0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Usp16Q99LG0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Usp16Q99LG0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Usp16Q99LG0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Usp16Q99LG0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Usp16Q99LG0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Usp16Q99LG0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Usp16Q99LG0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Usp16Q99LG0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Usp16Q99LG0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Usp16Q99LG0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Usp16Q99LG0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Usp16Q99LG0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Usp16Q99LG0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Usp16Q99LG0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Usp16Q99LG0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Usp16Q99LG0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Usp16Q99LG0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Usp16Q99LG0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Usp16Q99LG0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Usp16Q99LG0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Usp16Q99LG0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Usp16Q99LG0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Usp16Q99LG0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Usp16Q99LG0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Usp16Q99LG0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Usp16Q99LG0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Usp16Q99LG0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Usp16Q99LG0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Usp16Q99LG0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Usp16Q99LG0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Usp16Q99LG0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Usp16Q99LG0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Usp16Q99LG0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Usp16Q99LG0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Usp16Q99LG0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Usp16Q99LG0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Usp16Q99LG0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Usp16Q99LG0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Usp16Q99LG0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Usp16Q99LG0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Usp16Q99LG0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Usp16Q99LG0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Usp16Q99LG0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Usp16Q99LG0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Usp16Q99LG0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Usp16Q99LG0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Usp16Q99LG0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp16Q99LG0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp16Q99LG0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp16Q99LG0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp16Q99LG0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp16Q99LG0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp16Q99LG0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp16Q99LG0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp16Q99LG0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp16Q99LG0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Usp16Q99LG0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Usp16Q99LG0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Usp16Q99LG0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Usp16Q99LG0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Usp16Q99LG0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Usp16Q99LG0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Usp16Q99LG0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Usp16Q99LG0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Usp16Q99LG0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Usp16Q99LG0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Usp16Q99LG0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Usp16Q99LG0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Usp16Q99LG0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Usp16Q99LG0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Usp16Q99LG0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Usp16Q99LG0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Usp16Q99LG0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Usp16Q99LG0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Usp16Q99LG0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Usp16Q99LG0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Usp16Q99LG0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 184.1 ms