Protein–RNA interactions for Protein: Q99LC5

Etfa, Electron transfer flavoprotein subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EtfaQ99LC5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
EtfaQ99LC5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EtfaQ99LC5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EtfaQ99LC5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EtfaQ99LC5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EtfaQ99LC5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EtfaQ99LC5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EtfaQ99LC5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EtfaQ99LC5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EtfaQ99LC5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EtfaQ99LC5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EtfaQ99LC5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EtfaQ99LC5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EtfaQ99LC5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EtfaQ99LC5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EtfaQ99LC5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EtfaQ99LC5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EtfaQ99LC5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EtfaQ99LC5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EtfaQ99LC5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EtfaQ99LC5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EtfaQ99LC5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EtfaQ99LC5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EtfaQ99LC5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EtfaQ99LC5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EtfaQ99LC5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EtfaQ99LC5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EtfaQ99LC5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EtfaQ99LC5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
EtfaQ99LC5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EtfaQ99LC5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EtfaQ99LC5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EtfaQ99LC5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EtfaQ99LC5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EtfaQ99LC5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EtfaQ99LC5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EtfaQ99LC5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EtfaQ99LC5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EtfaQ99LC5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EtfaQ99LC5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EtfaQ99LC5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EtfaQ99LC5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EtfaQ99LC5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EtfaQ99LC5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EtfaQ99LC5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EtfaQ99LC5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EtfaQ99LC5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EtfaQ99LC5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EtfaQ99LC5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EtfaQ99LC5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EtfaQ99LC5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EtfaQ99LC5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EtfaQ99LC5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EtfaQ99LC5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EtfaQ99LC5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EtfaQ99LC5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EtfaQ99LC5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EtfaQ99LC5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EtfaQ99LC5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EtfaQ99LC5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EtfaQ99LC5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EtfaQ99LC5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EtfaQ99LC5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EtfaQ99LC5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EtfaQ99LC5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EtfaQ99LC5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EtfaQ99LC5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
EtfaQ99LC5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EtfaQ99LC5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
EtfaQ99LC5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EtfaQ99LC5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EtfaQ99LC5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EtfaQ99LC5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EtfaQ99LC5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EtfaQ99LC5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EtfaQ99LC5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EtfaQ99LC5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EtfaQ99LC5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EtfaQ99LC5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EtfaQ99LC5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EtfaQ99LC5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EtfaQ99LC5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EtfaQ99LC5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EtfaQ99LC5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EtfaQ99LC5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EtfaQ99LC5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EtfaQ99LC5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EtfaQ99LC5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EtfaQ99LC5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EtfaQ99LC5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EtfaQ99LC5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EtfaQ99LC5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EtfaQ99LC5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EtfaQ99LC5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EtfaQ99LC5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EtfaQ99LC5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EtfaQ99LC5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
EtfaQ99LC5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EtfaQ99LC5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EtfaQ99LC5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms