Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pacsin3Q99JB8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pacsin3Q99JB8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pacsin3Q99JB8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pacsin3Q99JB8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pacsin3Q99JB8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pacsin3Q99JB8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pacsin3Q99JB8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pacsin3Q99JB8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pacsin3Q99JB8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pacsin3Q99JB8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pacsin3Q99JB8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pacsin3Q99JB8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pacsin3Q99JB8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pacsin3Q99JB8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pacsin3Q99JB8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pacsin3Q99JB8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pacsin3Q99JB8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pacsin3Q99JB8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pacsin3Q99JB8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pacsin3Q99JB8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pacsin3Q99JB8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pacsin3Q99JB8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pacsin3Q99JB8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pacsin3Q99JB8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pacsin3Q99JB8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pacsin3Q99JB8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pacsin3Q99JB8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pacsin3Q99JB8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pacsin3Q99JB8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pacsin3Q99JB8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pacsin3Q99JB8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pacsin3Q99JB8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pacsin3Q99JB8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pacsin3Q99JB8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pacsin3Q99JB8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pacsin3Q99JB8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pacsin3Q99JB8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pacsin3Q99JB8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pacsin3Q99JB8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pacsin3Q99JB8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pacsin3Q99JB8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pacsin3Q99JB8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pacsin3Q99JB8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pacsin3Q99JB8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pacsin3Q99JB8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pacsin3Q99JB8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pacsin3Q99JB8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pacsin3Q99JB8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Pacsin3Q99JB8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pacsin3Q99JB8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pacsin3Q99JB8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pacsin3Q99JB8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pacsin3Q99JB8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pacsin3Q99JB8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pacsin3Q99JB8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pacsin3Q99JB8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pacsin3Q99JB8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pacsin3Q99JB8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pacsin3Q99JB8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pacsin3Q99JB8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pacsin3Q99JB8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pacsin3Q99JB8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pacsin3Q99JB8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pacsin3Q99JB8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Pacsin3Q99JB8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Pacsin3Q99JB8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pacsin3Q99JB8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pacsin3Q99JB8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pacsin3Q99JB8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pacsin3Q99JB8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pacsin3Q99JB8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pacsin3Q99JB8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pacsin3Q99JB8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pacsin3Q99JB8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pacsin3Q99JB8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pacsin3Q99JB8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pacsin3Q99JB8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pacsin3Q99JB8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pacsin3Q99JB8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pacsin3Q99JB8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pacsin3Q99JB8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pacsin3Q99JB8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pacsin3Q99JB8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pacsin3Q99JB8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pacsin3Q99JB8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pacsin3Q99JB8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pacsin3Q99JB8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Pacsin3Q99JB8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pacsin3Q99JB8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pacsin3Q99JB8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pacsin3Q99JB8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pacsin3Q99JB8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Pacsin3Q99JB8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pacsin3Q99JB8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pacsin3Q99JB8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pacsin3Q99JB8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pacsin3Q99JB8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pacsin3Q99JB8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pacsin3Q99JB8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms