Protein–RNA interactions for Protein: Q99J23

Ghdc, GH3 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GhdcQ99J23 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GhdcQ99J23 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GhdcQ99J23 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GhdcQ99J23 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GhdcQ99J23 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GhdcQ99J23 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GhdcQ99J23 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GhdcQ99J23 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GhdcQ99J23 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GhdcQ99J23 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GhdcQ99J23 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GhdcQ99J23 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GhdcQ99J23 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GhdcQ99J23 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GhdcQ99J23 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GhdcQ99J23 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GhdcQ99J23 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GhdcQ99J23 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GhdcQ99J23 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GhdcQ99J23 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GhdcQ99J23 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GhdcQ99J23 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GhdcQ99J23 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GhdcQ99J23 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GhdcQ99J23 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GhdcQ99J23 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GhdcQ99J23 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GhdcQ99J23 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GhdcQ99J23 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GhdcQ99J23 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GhdcQ99J23 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GhdcQ99J23 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GhdcQ99J23 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GhdcQ99J23 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GhdcQ99J23 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GhdcQ99J23 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GhdcQ99J23 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GhdcQ99J23 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GhdcQ99J23 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GhdcQ99J23 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GhdcQ99J23 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GhdcQ99J23 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GhdcQ99J23 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GhdcQ99J23 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GhdcQ99J23 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GhdcQ99J23 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GhdcQ99J23 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GhdcQ99J23 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GhdcQ99J23 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GhdcQ99J23 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GhdcQ99J23 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GhdcQ99J23 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GhdcQ99J23 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GhdcQ99J23 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GhdcQ99J23 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GhdcQ99J23 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GhdcQ99J23 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GhdcQ99J23 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GhdcQ99J23 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GhdcQ99J23 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GhdcQ99J23 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GhdcQ99J23 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GhdcQ99J23 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GhdcQ99J23 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GhdcQ99J23 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GhdcQ99J23 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GhdcQ99J23 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GhdcQ99J23 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GhdcQ99J23 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GhdcQ99J23 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GhdcQ99J23 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GhdcQ99J23 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GhdcQ99J23 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GhdcQ99J23 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GhdcQ99J23 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GhdcQ99J23 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GhdcQ99J23 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GhdcQ99J23 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GhdcQ99J23 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GhdcQ99J23 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GhdcQ99J23 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GhdcQ99J23 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GhdcQ99J23 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GhdcQ99J23 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GhdcQ99J23 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GhdcQ99J23 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GhdcQ99J23 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GhdcQ99J23 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GhdcQ99J23 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GhdcQ99J23 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GhdcQ99J23 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GhdcQ99J23 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GhdcQ99J23 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GhdcQ99J23 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GhdcQ99J23 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GhdcQ99J23 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GhdcQ99J23 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GhdcQ99J23 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GhdcQ99J23 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GhdcQ99J23 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.3 ms