Protein–RNA interactions for Protein: Q99J21

Mcoln1, Mucolipin-1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcoln1Q99J21 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mcoln1Q99J21 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mcoln1Q99J21 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mcoln1Q99J21 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mcoln1Q99J21 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mcoln1Q99J21 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mcoln1Q99J21 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mcoln1Q99J21 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mcoln1Q99J21 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mcoln1Q99J21 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mcoln1Q99J21 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mcoln1Q99J21 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Mcoln1Q99J21 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mcoln1Q99J21 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mcoln1Q99J21 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mcoln1Q99J21 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mcoln1Q99J21 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mcoln1Q99J21 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mcoln1Q99J21 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mcoln1Q99J21 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Mcoln1Q99J21 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mcoln1Q99J21 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mcoln1Q99J21 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mcoln1Q99J21 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mcoln1Q99J21 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mcoln1Q99J21 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mcoln1Q99J21 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mcoln1Q99J21 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Mcoln1Q99J21 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mcoln1Q99J21 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mcoln1Q99J21 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mcoln1Q99J21 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mcoln1Q99J21 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mcoln1Q99J21 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Mcoln1Q99J21 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mcoln1Q99J21 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mcoln1Q99J21 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mcoln1Q99J21 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mcoln1Q99J21 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mcoln1Q99J21 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mcoln1Q99J21 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mcoln1Q99J21 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mcoln1Q99J21 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mcoln1Q99J21 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mcoln1Q99J21 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mcoln1Q99J21 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mcoln1Q99J21 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mcoln1Q99J21 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mcoln1Q99J21 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mcoln1Q99J21 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mcoln1Q99J21 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mcoln1Q99J21 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mcoln1Q99J21 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mcoln1Q99J21 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mcoln1Q99J21 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mcoln1Q99J21 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mcoln1Q99J21 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mcoln1Q99J21 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mcoln1Q99J21 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mcoln1Q99J21 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mcoln1Q99J21 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mcoln1Q99J21 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mcoln1Q99J21 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mcoln1Q99J21 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mcoln1Q99J21 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mcoln1Q99J21 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mcoln1Q99J21 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mcoln1Q99J21 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Mcoln1Q99J21 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mcoln1Q99J21 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Mcoln1Q99J21 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Mcoln1Q99J21 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mcoln1Q99J21 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mcoln1Q99J21 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Mcoln1Q99J21 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mcoln1Q99J21 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mcoln1Q99J21 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mcoln1Q99J21 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mcoln1Q99J21 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mcoln1Q99J21 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mcoln1Q99J21 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mcoln1Q99J21 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mcoln1Q99J21 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mcoln1Q99J21 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mcoln1Q99J21 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mcoln1Q99J21 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mcoln1Q99J21 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mcoln1Q99J21 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mcoln1Q99J21 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Mcoln1Q99J21 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Mcoln1Q99J21 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mcoln1Q99J21 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mcoln1Q99J21 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mcoln1Q99J21 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mcoln1Q99J21 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Mcoln1Q99J21 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mcoln1Q99J21 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Mcoln1Q99J21 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mcoln1Q99J21 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mcoln1Q99J21 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms