Protein–RNA interactions for Protein: Q96DY5

Rnf112, RING finger protein 112, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf112Q96DY5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf112Q96DY5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf112Q96DY5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf112Q96DY5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf112Q96DY5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf112Q96DY5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf112Q96DY5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf112Q96DY5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf112Q96DY5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf112Q96DY5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf112Q96DY5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf112Q96DY5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf112Q96DY5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf112Q96DY5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf112Q96DY5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf112Q96DY5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf112Q96DY5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf112Q96DY5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf112Q96DY5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf112Q96DY5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf112Q96DY5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf112Q96DY5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf112Q96DY5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf112Q96DY5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf112Q96DY5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf112Q96DY5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf112Q96DY5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf112Q96DY5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf112Q96DY5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf112Q96DY5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf112Q96DY5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf112Q96DY5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf112Q96DY5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf112Q96DY5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf112Q96DY5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf112Q96DY5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf112Q96DY5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf112Q96DY5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf112Q96DY5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf112Q96DY5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf112Q96DY5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf112Q96DY5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf112Q96DY5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf112Q96DY5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf112Q96DY5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf112Q96DY5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf112Q96DY5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf112Q96DY5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf112Q96DY5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf112Q96DY5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf112Q96DY5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf112Q96DY5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf112Q96DY5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf112Q96DY5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf112Q96DY5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf112Q96DY5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf112Q96DY5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf112Q96DY5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf112Q96DY5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf112Q96DY5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf112Q96DY5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf112Q96DY5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf112Q96DY5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf112Q96DY5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rnf112Q96DY5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rnf112Q96DY5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rnf112Q96DY5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rnf112Q96DY5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf112Q96DY5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf112Q96DY5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf112Q96DY5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf112Q96DY5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf112Q96DY5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf112Q96DY5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf112Q96DY5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf112Q96DY5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf112Q96DY5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf112Q96DY5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf112Q96DY5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf112Q96DY5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf112Q96DY5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf112Q96DY5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf112Q96DY5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf112Q96DY5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf112Q96DY5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf112Q96DY5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf112Q96DY5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf112Q96DY5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf112Q96DY5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf112Q96DY5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf112Q96DY5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf112Q96DY5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf112Q96DY5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf112Q96DY5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf112Q96DY5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf112Q96DY5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf112Q96DY5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf112Q96DY5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf112Q96DY5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf112Q96DY5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms