Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Slc8b1Q925Q3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Slc8b1Q925Q3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Slc8b1Q925Q3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Slc8b1Q925Q3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Slc8b1Q925Q3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Slc8b1Q925Q3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Slc8b1Q925Q3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Slc8b1Q925Q3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Slc8b1Q925Q3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Slc8b1Q925Q3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Slc8b1Q925Q3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Slc8b1Q925Q3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Slc8b1Q925Q3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Slc8b1Q925Q3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Slc8b1Q925Q3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Slc8b1Q925Q3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Slc8b1Q925Q3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Slc8b1Q925Q3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Slc8b1Q925Q3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Slc8b1Q925Q3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Slc8b1Q925Q3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Slc8b1Q925Q3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Slc8b1Q925Q3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Slc8b1Q925Q3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Slc8b1Q925Q3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Slc8b1Q925Q3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Slc8b1Q925Q3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Slc8b1Q925Q3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Slc8b1Q925Q3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Slc8b1Q925Q3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Slc8b1Q925Q3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Slc8b1Q925Q3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Slc8b1Q925Q3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Slc8b1Q925Q3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Slc8b1Q925Q3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Slc8b1Q925Q3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Slc8b1Q925Q3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Slc8b1Q925Q3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Slc8b1Q925Q3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Slc8b1Q925Q3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Slc8b1Q925Q3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Slc8b1Q925Q3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Slc8b1Q925Q3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Slc8b1Q925Q3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Slc8b1Q925Q3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Slc8b1Q925Q3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Slc8b1Q925Q3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Slc8b1Q925Q3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Slc8b1Q925Q3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Slc8b1Q925Q3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Slc8b1Q925Q3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Slc8b1Q925Q3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Slc8b1Q925Q3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Slc8b1Q925Q3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Slc8b1Q925Q3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Slc8b1Q925Q3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Slc8b1Q925Q3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Slc8b1Q925Q3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Slc8b1Q925Q3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Slc8b1Q925Q3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Slc8b1Q925Q3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Slc8b1Q925Q3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Slc8b1Q925Q3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Slc8b1Q925Q3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Slc8b1Q925Q3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Slc8b1Q925Q3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Slc8b1Q925Q3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Slc8b1Q925Q3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Slc8b1Q925Q3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Slc8b1Q925Q3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Slc8b1Q925Q3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Slc8b1Q925Q3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Slc8b1Q925Q3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Slc8b1Q925Q3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Slc8b1Q925Q3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Slc8b1Q925Q3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Slc8b1Q925Q3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Slc8b1Q925Q3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Slc8b1Q925Q3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Slc8b1Q925Q3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Slc8b1Q925Q3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Slc8b1Q925Q3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Slc8b1Q925Q3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Slc8b1Q925Q3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Slc8b1Q925Q3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Slc8b1Q925Q3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Slc8b1Q925Q3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Slc8b1Q925Q3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Slc8b1Q925Q3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Slc8b1Q925Q3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Slc8b1Q925Q3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Slc8b1Q925Q3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Slc8b1Q925Q3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Slc8b1Q925Q3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Slc8b1Q925Q3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Slc8b1Q925Q3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Slc8b1Q925Q3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Slc8b1Q925Q3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Slc8b1Q925Q3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.2 ms