Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf144aQ925F3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf144aQ925F3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf144aQ925F3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf144aQ925F3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf144aQ925F3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf144aQ925F3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf144aQ925F3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf144aQ925F3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf144aQ925F3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf144aQ925F3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf144aQ925F3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf144aQ925F3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf144aQ925F3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf144aQ925F3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf144aQ925F3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf144aQ925F3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf144aQ925F3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf144aQ925F3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf144aQ925F3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf144aQ925F3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf144aQ925F3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf144aQ925F3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf144aQ925F3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf144aQ925F3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf144aQ925F3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf144aQ925F3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf144aQ925F3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf144aQ925F3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf144aQ925F3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf144aQ925F3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf144aQ925F3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf144aQ925F3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf144aQ925F3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf144aQ925F3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf144aQ925F3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf144aQ925F3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf144aQ925F3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf144aQ925F3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf144aQ925F3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf144aQ925F3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf144aQ925F3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf144aQ925F3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf144aQ925F3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf144aQ925F3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf144aQ925F3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf144aQ925F3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf144aQ925F3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf144aQ925F3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf144aQ925F3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf144aQ925F3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf144aQ925F3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf144aQ925F3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf144aQ925F3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf144aQ925F3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf144aQ925F3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf144aQ925F3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf144aQ925F3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf144aQ925F3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf144aQ925F3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf144aQ925F3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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Rnf144aQ925F3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnf144aQ925F3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnf144aQ925F3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnf144aQ925F3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnf144aQ925F3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnf144aQ925F3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnf144aQ925F3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rnf144aQ925F3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rnf144aQ925F3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rnf144aQ925F3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rnf144aQ925F3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rnf144aQ925F3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnf144aQ925F3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnf144aQ925F3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnf144aQ925F3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnf144aQ925F3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf144aQ925F3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf144aQ925F3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf144aQ925F3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf144aQ925F3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf144aQ925F3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf144aQ925F3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf144aQ925F3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf144aQ925F3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf144aQ925F3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf144aQ925F3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf144aQ925F3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf144aQ925F3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf144aQ925F3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf144aQ925F3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf144aQ925F3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf144aQ925F3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf144aQ925F3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf144aQ925F3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf144aQ925F3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf144aQ925F3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf144aQ925F3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf144aQ925F3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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