Protein–RNA interactions for Protein: Q924Y0

Bbox1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbox1Q924Y0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bbox1Q924Y0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bbox1Q924Y0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Bbox1Q924Y0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bbox1Q924Y0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bbox1Q924Y0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bbox1Q924Y0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bbox1Q924Y0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bbox1Q924Y0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bbox1Q924Y0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bbox1Q924Y0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bbox1Q924Y0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bbox1Q924Y0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bbox1Q924Y0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bbox1Q924Y0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bbox1Q924Y0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bbox1Q924Y0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bbox1Q924Y0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bbox1Q924Y0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bbox1Q924Y0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bbox1Q924Y0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bbox1Q924Y0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Bbox1Q924Y0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bbox1Q924Y0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bbox1Q924Y0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Bbox1Q924Y0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bbox1Q924Y0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bbox1Q924Y0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bbox1Q924Y0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bbox1Q924Y0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bbox1Q924Y0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bbox1Q924Y0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bbox1Q924Y0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bbox1Q924Y0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bbox1Q924Y0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bbox1Q924Y0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bbox1Q924Y0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bbox1Q924Y0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Bbox1Q924Y0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Bbox1Q924Y0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bbox1Q924Y0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bbox1Q924Y0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bbox1Q924Y0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bbox1Q924Y0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Bbox1Q924Y0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bbox1Q924Y0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bbox1Q924Y0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bbox1Q924Y0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bbox1Q924Y0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bbox1Q924Y0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bbox1Q924Y0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bbox1Q924Y0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bbox1Q924Y0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bbox1Q924Y0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bbox1Q924Y0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bbox1Q924Y0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bbox1Q924Y0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bbox1Q924Y0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bbox1Q924Y0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bbox1Q924Y0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bbox1Q924Y0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bbox1Q924Y0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bbox1Q924Y0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bbox1Q924Y0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bbox1Q924Y0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bbox1Q924Y0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bbox1Q924Y0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Bbox1Q924Y0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bbox1Q924Y0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bbox1Q924Y0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bbox1Q924Y0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bbox1Q924Y0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bbox1Q924Y0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bbox1Q924Y0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bbox1Q924Y0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bbox1Q924Y0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bbox1Q924Y0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bbox1Q924Y0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Bbox1Q924Y0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bbox1Q924Y0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bbox1Q924Y0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bbox1Q924Y0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bbox1Q924Y0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bbox1Q924Y0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Bbox1Q924Y0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bbox1Q924Y0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bbox1Q924Y0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bbox1Q924Y0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bbox1Q924Y0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bbox1Q924Y0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bbox1Q924Y0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bbox1Q924Y0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bbox1Q924Y0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bbox1Q924Y0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bbox1Q924Y0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bbox1Q924Y0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bbox1Q924Y0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Bbox1Q924Y0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bbox1Q924Y0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bbox1Q924Y0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms