Protein–RNA interactions for Protein: Q922B6

Traf7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf7Q922B6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Traf7Q922B6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Traf7Q922B6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Traf7Q922B6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Traf7Q922B6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Traf7Q922B6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Traf7Q922B6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Traf7Q922B6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Traf7Q922B6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Traf7Q922B6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Traf7Q922B6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Traf7Q922B6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Traf7Q922B6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Traf7Q922B6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Traf7Q922B6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Traf7Q922B6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Traf7Q922B6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Traf7Q922B6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Traf7Q922B6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Traf7Q922B6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Traf7Q922B6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Traf7Q922B6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Traf7Q922B6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Traf7Q922B6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Traf7Q922B6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Traf7Q922B6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Traf7Q922B6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Traf7Q922B6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Traf7Q922B6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Traf7Q922B6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Traf7Q922B6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Traf7Q922B6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Traf7Q922B6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Traf7Q922B6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Traf7Q922B6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Traf7Q922B6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Traf7Q922B6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Traf7Q922B6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Traf7Q922B6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Traf7Q922B6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Traf7Q922B6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Traf7Q922B6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Traf7Q922B6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Traf7Q922B6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Traf7Q922B6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Traf7Q922B6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Traf7Q922B6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Traf7Q922B6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Traf7Q922B6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Traf7Q922B6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Traf7Q922B6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Traf7Q922B6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Traf7Q922B6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Traf7Q922B6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Traf7Q922B6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Traf7Q922B6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Traf7Q922B6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Traf7Q922B6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Traf7Q922B6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Traf7Q922B6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Traf7Q922B6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Traf7Q922B6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Traf7Q922B6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Traf7Q922B6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Traf7Q922B6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Traf7Q922B6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Traf7Q922B6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Traf7Q922B6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Traf7Q922B6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Traf7Q922B6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Traf7Q922B6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Traf7Q922B6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Traf7Q922B6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Traf7Q922B6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Traf7Q922B6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Traf7Q922B6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Traf7Q922B6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Traf7Q922B6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Traf7Q922B6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Traf7Q922B6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Traf7Q922B6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Traf7Q922B6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Traf7Q922B6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Traf7Q922B6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Traf7Q922B6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Traf7Q922B6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Traf7Q922B6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Traf7Q922B6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Traf7Q922B6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Traf7Q922B6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Traf7Q922B6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Traf7Q922B6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Traf7Q922B6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Traf7Q922B6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Traf7Q922B6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Traf7Q922B6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Traf7Q922B6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Traf7Q922B6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Traf7Q922B6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Traf7Q922B6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms