Protein–RNA interactions for Protein: Q920F6

Smc1b, Structural maintenance of chromosomes protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1bQ920F6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smc1bQ920F6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smc1bQ920F6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smc1bQ920F6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smc1bQ920F6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smc1bQ920F6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smc1bQ920F6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smc1bQ920F6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smc1bQ920F6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Smc1bQ920F6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smc1bQ920F6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smc1bQ920F6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smc1bQ920F6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smc1bQ920F6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smc1bQ920F6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Smc1bQ920F6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smc1bQ920F6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smc1bQ920F6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smc1bQ920F6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smc1bQ920F6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smc1bQ920F6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smc1bQ920F6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smc1bQ920F6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smc1bQ920F6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smc1bQ920F6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smc1bQ920F6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smc1bQ920F6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smc1bQ920F6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smc1bQ920F6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Smc1bQ920F6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Smc1bQ920F6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smc1bQ920F6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smc1bQ920F6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smc1bQ920F6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smc1bQ920F6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smc1bQ920F6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smc1bQ920F6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smc1bQ920F6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smc1bQ920F6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smc1bQ920F6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smc1bQ920F6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smc1bQ920F6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smc1bQ920F6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smc1bQ920F6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smc1bQ920F6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smc1bQ920F6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smc1bQ920F6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smc1bQ920F6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smc1bQ920F6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smc1bQ920F6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smc1bQ920F6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smc1bQ920F6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smc1bQ920F6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smc1bQ920F6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smc1bQ920F6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smc1bQ920F6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smc1bQ920F6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smc1bQ920F6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smc1bQ920F6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smc1bQ920F6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smc1bQ920F6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smc1bQ920F6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smc1bQ920F6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smc1bQ920F6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smc1bQ920F6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smc1bQ920F6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smc1bQ920F6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smc1bQ920F6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smc1bQ920F6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smc1bQ920F6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smc1bQ920F6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Smc1bQ920F6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smc1bQ920F6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smc1bQ920F6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smc1bQ920F6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smc1bQ920F6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smc1bQ920F6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smc1bQ920F6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smc1bQ920F6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smc1bQ920F6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smc1bQ920F6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Smc1bQ920F6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smc1bQ920F6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smc1bQ920F6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smc1bQ920F6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smc1bQ920F6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smc1bQ920F6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smc1bQ920F6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smc1bQ920F6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smc1bQ920F6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smc1bQ920F6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smc1bQ920F6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smc1bQ920F6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smc1bQ920F6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smc1bQ920F6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smc1bQ920F6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smc1bQ920F6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smc1bQ920F6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smc1bQ920F6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Smc1bQ920F6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms