Protein–RNA interactions for Protein: Q920E5

Fdps, Farnesyl pyrophosphate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FdpsQ920E5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FdpsQ920E5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FdpsQ920E5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FdpsQ920E5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FdpsQ920E5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FdpsQ920E5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FdpsQ920E5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FdpsQ920E5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FdpsQ920E5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FdpsQ920E5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FdpsQ920E5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FdpsQ920E5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FdpsQ920E5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FdpsQ920E5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FdpsQ920E5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FdpsQ920E5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FdpsQ920E5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FdpsQ920E5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FdpsQ920E5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FdpsQ920E5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FdpsQ920E5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FdpsQ920E5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FdpsQ920E5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FdpsQ920E5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FdpsQ920E5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FdpsQ920E5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FdpsQ920E5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FdpsQ920E5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FdpsQ920E5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FdpsQ920E5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FdpsQ920E5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FdpsQ920E5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FdpsQ920E5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FdpsQ920E5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FdpsQ920E5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FdpsQ920E5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FdpsQ920E5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FdpsQ920E5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FdpsQ920E5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FdpsQ920E5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FdpsQ920E5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FdpsQ920E5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FdpsQ920E5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FdpsQ920E5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FdpsQ920E5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FdpsQ920E5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FdpsQ920E5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FdpsQ920E5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FdpsQ920E5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FdpsQ920E5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FdpsQ920E5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FdpsQ920E5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FdpsQ920E5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FdpsQ920E5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FdpsQ920E5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FdpsQ920E5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FdpsQ920E5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FdpsQ920E5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FdpsQ920E5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FdpsQ920E5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FdpsQ920E5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FdpsQ920E5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FdpsQ920E5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FdpsQ920E5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FdpsQ920E5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FdpsQ920E5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FdpsQ920E5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FdpsQ920E5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FdpsQ920E5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FdpsQ920E5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FdpsQ920E5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FdpsQ920E5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FdpsQ920E5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FdpsQ920E5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FdpsQ920E5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FdpsQ920E5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FdpsQ920E5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FdpsQ920E5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FdpsQ920E5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FdpsQ920E5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FdpsQ920E5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FdpsQ920E5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FdpsQ920E5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FdpsQ920E5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FdpsQ920E5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FdpsQ920E5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FdpsQ920E5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FdpsQ920E5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FdpsQ920E5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FdpsQ920E5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FdpsQ920E5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FdpsQ920E5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FdpsQ920E5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FdpsQ920E5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FdpsQ920E5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FdpsQ920E5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FdpsQ920E5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
FdpsQ920E5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FdpsQ920E5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FdpsQ920E5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms