Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR2

Snx18, Sorting nexin-18, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18Q91ZR2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx18Q91ZR2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx18Q91ZR2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx18Q91ZR2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx18Q91ZR2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx18Q91ZR2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx18Q91ZR2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx18Q91ZR2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx18Q91ZR2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx18Q91ZR2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx18Q91ZR2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx18Q91ZR2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx18Q91ZR2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx18Q91ZR2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx18Q91ZR2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx18Q91ZR2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx18Q91ZR2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx18Q91ZR2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx18Q91ZR2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx18Q91ZR2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx18Q91ZR2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx18Q91ZR2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx18Q91ZR2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx18Q91ZR2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx18Q91ZR2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx18Q91ZR2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx18Q91ZR2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx18Q91ZR2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx18Q91ZR2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx18Q91ZR2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx18Q91ZR2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx18Q91ZR2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx18Q91ZR2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx18Q91ZR2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx18Q91ZR2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx18Q91ZR2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx18Q91ZR2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx18Q91ZR2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx18Q91ZR2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx18Q91ZR2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx18Q91ZR2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx18Q91ZR2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx18Q91ZR2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx18Q91ZR2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx18Q91ZR2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx18Q91ZR2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx18Q91ZR2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx18Q91ZR2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx18Q91ZR2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx18Q91ZR2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx18Q91ZR2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx18Q91ZR2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx18Q91ZR2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx18Q91ZR2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx18Q91ZR2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx18Q91ZR2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx18Q91ZR2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx18Q91ZR2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx18Q91ZR2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx18Q91ZR2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx18Q91ZR2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx18Q91ZR2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx18Q91ZR2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx18Q91ZR2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx18Q91ZR2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx18Q91ZR2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx18Q91ZR2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx18Q91ZR2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx18Q91ZR2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx18Q91ZR2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx18Q91ZR2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx18Q91ZR2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx18Q91ZR2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx18Q91ZR2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx18Q91ZR2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx18Q91ZR2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx18Q91ZR2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx18Q91ZR2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx18Q91ZR2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx18Q91ZR2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx18Q91ZR2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx18Q91ZR2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx18Q91ZR2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx18Q91ZR2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx18Q91ZR2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx18Q91ZR2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx18Q91ZR2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snx18Q91ZR2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snx18Q91ZR2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx18Q91ZR2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx18Q91ZR2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx18Q91ZR2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx18Q91ZR2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx18Q91ZR2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx18Q91ZR2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx18Q91ZR2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx18Q91ZR2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx18Q91ZR2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx18Q91ZR2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx18Q91ZR2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms