Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ5

Rpe65, Retinoid isomerohydrolase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpe65Q91ZQ5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rpe65Q91ZQ5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rpe65Q91ZQ5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Rpe65Q91ZQ5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rpe65Q91ZQ5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rpe65Q91ZQ5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rpe65Q91ZQ5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rpe65Q91ZQ5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rpe65Q91ZQ5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rpe65Q91ZQ5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rpe65Q91ZQ5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rpe65Q91ZQ5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rpe65Q91ZQ5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rpe65Q91ZQ5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rpe65Q91ZQ5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rpe65Q91ZQ5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rpe65Q91ZQ5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rpe65Q91ZQ5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rpe65Q91ZQ5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Rpe65Q91ZQ5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rpe65Q91ZQ5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rpe65Q91ZQ5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rpe65Q91ZQ5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rpe65Q91ZQ5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rpe65Q91ZQ5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rpe65Q91ZQ5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rpe65Q91ZQ5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rpe65Q91ZQ5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rpe65Q91ZQ5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rpe65Q91ZQ5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rpe65Q91ZQ5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rpe65Q91ZQ5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rpe65Q91ZQ5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rpe65Q91ZQ5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rpe65Q91ZQ5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rpe65Q91ZQ5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rpe65Q91ZQ5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rpe65Q91ZQ5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rpe65Q91ZQ5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rpe65Q91ZQ5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rpe65Q91ZQ5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rpe65Q91ZQ5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rpe65Q91ZQ5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rpe65Q91ZQ5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rpe65Q91ZQ5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rpe65Q91ZQ5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rpe65Q91ZQ5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rpe65Q91ZQ5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rpe65Q91ZQ5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rpe65Q91ZQ5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rpe65Q91ZQ5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rpe65Q91ZQ5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rpe65Q91ZQ5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rpe65Q91ZQ5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rpe65Q91ZQ5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rpe65Q91ZQ5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rpe65Q91ZQ5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rpe65Q91ZQ5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rpe65Q91ZQ5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Rpe65Q91ZQ5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rpe65Q91ZQ5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Rpe65Q91ZQ5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rpe65Q91ZQ5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Rpe65Q91ZQ5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rpe65Q91ZQ5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rpe65Q91ZQ5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rpe65Q91ZQ5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rpe65Q91ZQ5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rpe65Q91ZQ5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rpe65Q91ZQ5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rpe65Q91ZQ5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rpe65Q91ZQ5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rpe65Q91ZQ5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rpe65Q91ZQ5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rpe65Q91ZQ5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rpe65Q91ZQ5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rpe65Q91ZQ5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rpe65Q91ZQ5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rpe65Q91ZQ5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rpe65Q91ZQ5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rpe65Q91ZQ5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rpe65Q91ZQ5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rpe65Q91ZQ5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rpe65Q91ZQ5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rpe65Q91ZQ5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rpe65Q91ZQ5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rpe65Q91ZQ5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rpe65Q91ZQ5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Rpe65Q91ZQ5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rpe65Q91ZQ5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rpe65Q91ZQ5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rpe65Q91ZQ5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rpe65Q91ZQ5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rpe65Q91ZQ5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rpe65Q91ZQ5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rpe65Q91ZQ5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rpe65Q91ZQ5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rpe65Q91ZQ5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rpe65Q91ZQ5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rpe65Q91ZQ5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms