Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y21

Pcdha1, Protocadherin alpha 1, mousemouse

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha1Q91Y21 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdha1Q91Y21 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdha1Q91Y21 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdha1Q91Y21 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdha1Q91Y21 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdha1Q91Y21 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdha1Q91Y21 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdha1Q91Y21 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdha1Q91Y21 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdha1Q91Y21 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdha1Q91Y21 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdha1Q91Y21 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdha1Q91Y21 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdha1Q91Y21 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdha1Q91Y21 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pcdha1Q91Y21 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pcdha1Q91Y21 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pcdha1Q91Y21 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pcdha1Q91Y21 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pcdha1Q91Y21 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcdha1Q91Y21 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcdha1Q91Y21 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdha1Q91Y21 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdha1Q91Y21 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdha1Q91Y21 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdha1Q91Y21 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdha1Q91Y21 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdha1Q91Y21 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdha1Q91Y21 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdha1Q91Y21 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdha1Q91Y21 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdha1Q91Y21 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdha1Q91Y21 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdha1Q91Y21 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdha1Q91Y21 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdha1Q91Y21 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdha1Q91Y21 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdha1Q91Y21 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdha1Q91Y21 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdha1Q91Y21 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdha1Q91Y21 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdha1Q91Y21 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdha1Q91Y21 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdha1Q91Y21 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdha1Q91Y21 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdha1Q91Y21 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdha1Q91Y21 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdha1Q91Y21 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdha1Q91Y21 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdha1Q91Y21 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdha1Q91Y21 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdha1Q91Y21 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdha1Q91Y21 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdha1Q91Y21 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdha1Q91Y21 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdha1Q91Y21 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdha1Q91Y21 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdha1Q91Y21 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdha1Q91Y21 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdha1Q91Y21 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdha1Q91Y21 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcdha1Q91Y21 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcdha1Q91Y21 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcdha1Q91Y21 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcdha1Q91Y21 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pcdha1Q91Y21 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pcdha1Q91Y21 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pcdha1Q91Y21 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pcdha1Q91Y21 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdha1Q91Y21 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdha1Q91Y21 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdha1Q91Y21 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdha1Q91Y21 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdha1Q91Y21 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdha1Q91Y21 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdha1Q91Y21 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdha1Q91Y21 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdha1Q91Y21 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdha1Q91Y21 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdha1Q91Y21 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdha1Q91Y21 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdha1Q91Y21 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcdha1Q91Y21 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcdha1Q91Y21 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcdha1Q91Y21 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcdha1Q91Y21 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcdha1Q91Y21 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcdha1Q91Y21 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcdha1Q91Y21 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdha1Q91Y21 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdha1Q91Y21 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdha1Q91Y21 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdha1Q91Y21 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdha1Q91Y21 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdha1Q91Y21 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdha1Q91Y21 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdha1Q91Y21 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdha1Q91Y21 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdha1Q91Y21 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdha1Q91Y21 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms