Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y07

Pcdhb12, MCG141300, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb12Q91Y07 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcdhb12Q91Y07 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcdhb12Q91Y07 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcdhb12Q91Y07 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pcdhb12Q91Y07 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pcdhb12Q91Y07 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Pcdhb12Q91Y07 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pcdhb12Q91Y07 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pcdhb12Q91Y07 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pcdhb12Q91Y07 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pcdhb12Q91Y07 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pcdhb12Q91Y07 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pcdhb12Q91Y07 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pcdhb12Q91Y07 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pcdhb12Q91Y07 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pcdhb12Q91Y07 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pcdhb12Q91Y07 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pcdhb12Q91Y07 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pcdhb12Q91Y07 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pcdhb12Q91Y07 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pcdhb12Q91Y07 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pcdhb12Q91Y07 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pcdhb12Q91Y07 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pcdhb12Q91Y07 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pcdhb12Q91Y07 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pcdhb12Q91Y07 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pcdhb12Q91Y07 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pcdhb12Q91Y07 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pcdhb12Q91Y07 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcdhb12Q91Y07 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcdhb12Q91Y07 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcdhb12Q91Y07 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcdhb12Q91Y07 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcdhb12Q91Y07 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcdhb12Q91Y07 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pcdhb12Q91Y07 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pcdhb12Q91Y07 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Pcdhb12Q91Y07 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pcdhb12Q91Y07 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcdhb12Q91Y07 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcdhb12Q91Y07 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcdhb12Q91Y07 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcdhb12Q91Y07 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcdhb12Q91Y07 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcdhb12Q91Y07 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pcdhb12Q91Y07 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pcdhb12Q91Y07 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Pcdhb12Q91Y07 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pcdhb12Q91Y07 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pcdhb12Q91Y07 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pcdhb12Q91Y07 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcdhb12Q91Y07 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcdhb12Q91Y07 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcdhb12Q91Y07 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcdhb12Q91Y07 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcdhb12Q91Y07 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcdhb12Q91Y07 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pcdhb12Q91Y07 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pcdhb12Q91Y07 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pcdhb12Q91Y07 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pcdhb12Q91Y07 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pcdhb12Q91Y07 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pcdhb12Q91Y07 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pcdhb12Q91Y07 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcdhb12Q91Y07 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcdhb12Q91Y07 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcdhb12Q91Y07 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcdhb12Q91Y07 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcdhb12Q91Y07 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcdhb12Q91Y07 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcdhb12Q91Y07 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcdhb12Q91Y07 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pcdhb12Q91Y07 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pcdhb12Q91Y07 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Pcdhb12Q91Y07 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pcdhb12Q91Y07 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pcdhb12Q91Y07 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pcdhb12Q91Y07 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pcdhb12Q91Y07 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pcdhb12Q91Y07 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Pcdhb12Q91Y07 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pcdhb12Q91Y07 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pcdhb12Q91Y07 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pcdhb12Q91Y07 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcdhb12Q91Y07 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcdhb12Q91Y07 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcdhb12Q91Y07 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcdhb12Q91Y07 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcdhb12Q91Y07 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcdhb12Q91Y07 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcdhb12Q91Y07 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcdhb12Q91Y07 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcdhb12Q91Y07 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcdhb12Q91Y07 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcdhb12Q91Y07 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcdhb12Q91Y07 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcdhb12Q91Y07 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcdhb12Q91Y07 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcdhb12Q91Y07 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcdhb12Q91Y07 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms