Protein–RNA interactions for Protein: Q91VK4

Itm2c, Integral membrane protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itm2cQ91VK4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Itm2cQ91VK4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Itm2cQ91VK4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Itm2cQ91VK4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Itm2cQ91VK4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Itm2cQ91VK4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Itm2cQ91VK4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Itm2cQ91VK4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Itm2cQ91VK4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Itm2cQ91VK4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Itm2cQ91VK4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Itm2cQ91VK4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Itm2cQ91VK4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Itm2cQ91VK4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Itm2cQ91VK4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Itm2cQ91VK4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Itm2cQ91VK4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Itm2cQ91VK4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Itm2cQ91VK4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Itm2cQ91VK4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Itm2cQ91VK4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Itm2cQ91VK4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Itm2cQ91VK4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Itm2cQ91VK4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Itm2cQ91VK4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Itm2cQ91VK4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Itm2cQ91VK4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Itm2cQ91VK4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Itm2cQ91VK4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Itm2cQ91VK4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Itm2cQ91VK4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Itm2cQ91VK4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Itm2cQ91VK4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Itm2cQ91VK4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Itm2cQ91VK4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Itm2cQ91VK4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Itm2cQ91VK4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Itm2cQ91VK4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Itm2cQ91VK4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Itm2cQ91VK4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Itm2cQ91VK4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Itm2cQ91VK4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Itm2cQ91VK4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Itm2cQ91VK4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Itm2cQ91VK4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Itm2cQ91VK4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Itm2cQ91VK4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Itm2cQ91VK4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Itm2cQ91VK4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Itm2cQ91VK4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Itm2cQ91VK4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Itm2cQ91VK4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Itm2cQ91VK4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Itm2cQ91VK4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Itm2cQ91VK4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Itm2cQ91VK4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Itm2cQ91VK4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Itm2cQ91VK4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Itm2cQ91VK4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Itm2cQ91VK4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Itm2cQ91VK4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Itm2cQ91VK4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Itm2cQ91VK4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Itm2cQ91VK4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Itm2cQ91VK4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Itm2cQ91VK4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Itm2cQ91VK4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Itm2cQ91VK4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Itm2cQ91VK4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Itm2cQ91VK4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Itm2cQ91VK4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Itm2cQ91VK4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Itm2cQ91VK4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Itm2cQ91VK4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Itm2cQ91VK4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Itm2cQ91VK4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Itm2cQ91VK4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Itm2cQ91VK4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Itm2cQ91VK4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Itm2cQ91VK4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Itm2cQ91VK4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Itm2cQ91VK4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Itm2cQ91VK4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Itm2cQ91VK4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Itm2cQ91VK4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Itm2cQ91VK4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Itm2cQ91VK4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Itm2cQ91VK4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Itm2cQ91VK4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Itm2cQ91VK4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Itm2cQ91VK4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Itm2cQ91VK4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Itm2cQ91VK4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Itm2cQ91VK4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Itm2cQ91VK4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Itm2cQ91VK4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Itm2cQ91VK4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Itm2cQ91VK4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Itm2cQ91VK4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Itm2cQ91VK4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms