Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hps3Q91VB4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hps3Q91VB4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hps3Q91VB4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hps3Q91VB4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hps3Q91VB4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hps3Q91VB4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hps3Q91VB4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hps3Q91VB4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hps3Q91VB4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hps3Q91VB4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hps3Q91VB4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hps3Q91VB4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hps3Q91VB4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hps3Q91VB4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hps3Q91VB4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hps3Q91VB4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Hps3Q91VB4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hps3Q91VB4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hps3Q91VB4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hps3Q91VB4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hps3Q91VB4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hps3Q91VB4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Hps3Q91VB4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hps3Q91VB4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hps3Q91VB4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Hps3Q91VB4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hps3Q91VB4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hps3Q91VB4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hps3Q91VB4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hps3Q91VB4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hps3Q91VB4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hps3Q91VB4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hps3Q91VB4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hps3Q91VB4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hps3Q91VB4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hps3Q91VB4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hps3Q91VB4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hps3Q91VB4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hps3Q91VB4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hps3Q91VB4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hps3Q91VB4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hps3Q91VB4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hps3Q91VB4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Hps3Q91VB4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hps3Q91VB4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hps3Q91VB4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hps3Q91VB4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hps3Q91VB4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hps3Q91VB4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hps3Q91VB4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hps3Q91VB4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Hps3Q91VB4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hps3Q91VB4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hps3Q91VB4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hps3Q91VB4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hps3Q91VB4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hps3Q91VB4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hps3Q91VB4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hps3Q91VB4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hps3Q91VB4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hps3Q91VB4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hps3Q91VB4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hps3Q91VB4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hps3Q91VB4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hps3Q91VB4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hps3Q91VB4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hps3Q91VB4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hps3Q91VB4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Hps3Q91VB4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hps3Q91VB4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hps3Q91VB4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hps3Q91VB4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hps3Q91VB4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hps3Q91VB4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hps3Q91VB4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hps3Q91VB4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hps3Q91VB4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hps3Q91VB4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hps3Q91VB4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hps3Q91VB4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hps3Q91VB4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hps3Q91VB4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hps3Q91VB4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hps3Q91VB4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hps3Q91VB4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hps3Q91VB4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hps3Q91VB4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hps3Q91VB4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Hps3Q91VB4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Hps3Q91VB4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hps3Q91VB4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hps3Q91VB4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hps3Q91VB4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hps3Q91VB4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hps3Q91VB4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hps3Q91VB4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Hps3Q91VB4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hps3Q91VB4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hps3Q91VB4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms