Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS3

Cbx7, Chromobox protein homolog 7, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx7Q8VDS3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cbx7Q8VDS3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cbx7Q8VDS3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cbx7Q8VDS3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cbx7Q8VDS3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cbx7Q8VDS3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cbx7Q8VDS3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cbx7Q8VDS3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cbx7Q8VDS3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cbx7Q8VDS3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cbx7Q8VDS3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cbx7Q8VDS3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cbx7Q8VDS3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cbx7Q8VDS3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cbx7Q8VDS3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cbx7Q8VDS3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cbx7Q8VDS3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cbx7Q8VDS3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cbx7Q8VDS3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cbx7Q8VDS3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cbx7Q8VDS3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Cbx7Q8VDS3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cbx7Q8VDS3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cbx7Q8VDS3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cbx7Q8VDS3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cbx7Q8VDS3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cbx7Q8VDS3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cbx7Q8VDS3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cbx7Q8VDS3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cbx7Q8VDS3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cbx7Q8VDS3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cbx7Q8VDS3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cbx7Q8VDS3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cbx7Q8VDS3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cbx7Q8VDS3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cbx7Q8VDS3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cbx7Q8VDS3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cbx7Q8VDS3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Cbx7Q8VDS3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cbx7Q8VDS3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Cbx7Q8VDS3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cbx7Q8VDS3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cbx7Q8VDS3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cbx7Q8VDS3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cbx7Q8VDS3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Cbx7Q8VDS3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cbx7Q8VDS3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cbx7Q8VDS3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cbx7Q8VDS3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cbx7Q8VDS3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cbx7Q8VDS3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cbx7Q8VDS3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cbx7Q8VDS3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cbx7Q8VDS3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cbx7Q8VDS3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Cbx7Q8VDS3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cbx7Q8VDS3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cbx7Q8VDS3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cbx7Q8VDS3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cbx7Q8VDS3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cbx7Q8VDS3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cbx7Q8VDS3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cbx7Q8VDS3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cbx7Q8VDS3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cbx7Q8VDS3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cbx7Q8VDS3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cbx7Q8VDS3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cbx7Q8VDS3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cbx7Q8VDS3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cbx7Q8VDS3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cbx7Q8VDS3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cbx7Q8VDS3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cbx7Q8VDS3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cbx7Q8VDS3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cbx7Q8VDS3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cbx7Q8VDS3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cbx7Q8VDS3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cbx7Q8VDS3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cbx7Q8VDS3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Cbx7Q8VDS3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cbx7Q8VDS3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cbx7Q8VDS3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cbx7Q8VDS3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cbx7Q8VDS3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cbx7Q8VDS3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cbx7Q8VDS3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cbx7Q8VDS3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cbx7Q8VDS3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cbx7Q8VDS3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cbx7Q8VDS3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cbx7Q8VDS3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cbx7Q8VDS3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cbx7Q8VDS3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cbx7Q8VDS3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cbx7Q8VDS3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cbx7Q8VDS3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cbx7Q8VDS3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cbx7Q8VDS3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cbx7Q8VDS3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cbx7Q8VDS3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms