Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Fyco1Q8VDC1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Fyco1Q8VDC1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Fyco1Q8VDC1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
Fyco1Q8VDC1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Fyco1Q8VDC1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Fyco1Q8VDC1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Fyco1Q8VDC1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Fyco1Q8VDC1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Fyco1Q8VDC1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
Fyco1Q8VDC1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
Fyco1Q8VDC1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Fyco1Q8VDC1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Fyco1Q8VDC1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Fyco1Q8VDC1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Fyco1Q8VDC1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Fyco1Q8VDC1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Fyco1Q8VDC1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Fyco1Q8VDC1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Fyco1Q8VDC1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Fyco1Q8VDC1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Fyco1Q8VDC1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■■□ 3
Fyco1Q8VDC1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Fyco1Q8VDC1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Fyco1Q8VDC1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
Fyco1Q8VDC1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Fyco1Q8VDC1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Fyco1Q8VDC1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Fyco1Q8VDC1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Fyco1Q8VDC1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Fyco1Q8VDC1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Fyco1Q8VDC1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Fyco1Q8VDC1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Fyco1Q8VDC1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Fyco1Q8VDC1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
Fyco1Q8VDC1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Fyco1Q8VDC1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Fyco1Q8VDC1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Fyco1Q8VDC1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Fyco1Q8VDC1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Fyco1Q8VDC1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Fyco1Q8VDC1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Fyco1Q8VDC1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Fyco1Q8VDC1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Fyco1Q8VDC1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Fyco1Q8VDC1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Fyco1Q8VDC1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Fyco1Q8VDC1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Fyco1Q8VDC1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Fyco1Q8VDC1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Fyco1Q8VDC1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
Fyco1Q8VDC1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
Fyco1Q8VDC1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC33.7■■■□□ 2.98
Fyco1Q8VDC1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Fyco1Q8VDC1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
Fyco1Q8VDC1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Fyco1Q8VDC1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Fyco1Q8VDC1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Fyco1Q8VDC1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Fyco1Q8VDC1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Fyco1Q8VDC1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Fyco1Q8VDC1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
Fyco1Q8VDC1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
Fyco1Q8VDC1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Fyco1Q8VDC1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Fyco1Q8VDC1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Fyco1Q8VDC1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Fyco1Q8VDC1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Fyco1Q8VDC1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Fyco1Q8VDC1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Fyco1Q8VDC1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
Fyco1Q8VDC1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Fyco1Q8VDC1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Fyco1Q8VDC1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Fyco1Q8VDC1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Fyco1Q8VDC1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Fyco1Q8VDC1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Fyco1Q8VDC1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Fyco1Q8VDC1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Fyco1Q8VDC1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Fyco1Q8VDC1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Fyco1Q8VDC1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Fyco1Q8VDC1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Fyco1Q8VDC1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Fyco1Q8VDC1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Fyco1Q8VDC1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
Fyco1Q8VDC1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Fyco1Q8VDC1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Fyco1Q8VDC1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Fyco1Q8VDC1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Fyco1Q8VDC1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Fyco1Q8VDC1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Fyco1Q8VDC1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Fyco1Q8VDC1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Fyco1Q8VDC1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Fyco1Q8VDC1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Fyco1Q8VDC1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
Fyco1Q8VDC1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Fyco1Q8VDC1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Fyco1Q8VDC1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms