Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBY2

Camkk1, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Camkk1Q8VBY2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Camkk1Q8VBY2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Camkk1Q8VBY2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Camkk1Q8VBY2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Camkk1Q8VBY2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Camkk1Q8VBY2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Camkk1Q8VBY2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Camkk1Q8VBY2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Camkk1Q8VBY2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Camkk1Q8VBY2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Camkk1Q8VBY2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Camkk1Q8VBY2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Camkk1Q8VBY2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Camkk1Q8VBY2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Camkk1Q8VBY2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Camkk1Q8VBY2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Camkk1Q8VBY2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Camkk1Q8VBY2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Camkk1Q8VBY2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Camkk1Q8VBY2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Camkk1Q8VBY2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Camkk1Q8VBY2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Camkk1Q8VBY2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Camkk1Q8VBY2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Camkk1Q8VBY2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Camkk1Q8VBY2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Camkk1Q8VBY2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Camkk1Q8VBY2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Camkk1Q8VBY2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Camkk1Q8VBY2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Camkk1Q8VBY2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Camkk1Q8VBY2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Camkk1Q8VBY2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Camkk1Q8VBY2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Camkk1Q8VBY2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Camkk1Q8VBY2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Camkk1Q8VBY2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Camkk1Q8VBY2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Camkk1Q8VBY2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Camkk1Q8VBY2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Camkk1Q8VBY2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Camkk1Q8VBY2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Camkk1Q8VBY2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Camkk1Q8VBY2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Camkk1Q8VBY2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Camkk1Q8VBY2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Camkk1Q8VBY2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Camkk1Q8VBY2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Camkk1Q8VBY2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Camkk1Q8VBY2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Camkk1Q8VBY2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Camkk1Q8VBY2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Camkk1Q8VBY2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Camkk1Q8VBY2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Camkk1Q8VBY2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Camkk1Q8VBY2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Camkk1Q8VBY2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Camkk1Q8VBY2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Camkk1Q8VBY2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Camkk1Q8VBY2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Camkk1Q8VBY2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Camkk1Q8VBY2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Camkk1Q8VBY2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Camkk1Q8VBY2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Camkk1Q8VBY2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Camkk1Q8VBY2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Camkk1Q8VBY2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Camkk1Q8VBY2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Camkk1Q8VBY2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Camkk1Q8VBY2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Camkk1Q8VBY2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Camkk1Q8VBY2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Camkk1Q8VBY2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Camkk1Q8VBY2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Camkk1Q8VBY2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Camkk1Q8VBY2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Camkk1Q8VBY2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Camkk1Q8VBY2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Camkk1Q8VBY2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Camkk1Q8VBY2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Camkk1Q8VBY2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Camkk1Q8VBY2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Camkk1Q8VBY2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Camkk1Q8VBY2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Camkk1Q8VBY2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Camkk1Q8VBY2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Camkk1Q8VBY2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Camkk1Q8VBY2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Camkk1Q8VBY2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Camkk1Q8VBY2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Camkk1Q8VBY2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Camkk1Q8VBY2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Camkk1Q8VBY2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Camkk1Q8VBY2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Camkk1Q8VBY2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Camkk1Q8VBY2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Camkk1Q8VBY2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Camkk1Q8VBY2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Camkk1Q8VBY2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Camkk1Q8VBY2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms