Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT2

Sds, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdsQ8VBT2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SdsQ8VBT2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SdsQ8VBT2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SdsQ8VBT2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SdsQ8VBT2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SdsQ8VBT2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SdsQ8VBT2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SdsQ8VBT2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SdsQ8VBT2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SdsQ8VBT2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SdsQ8VBT2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SdsQ8VBT2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SdsQ8VBT2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SdsQ8VBT2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SdsQ8VBT2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SdsQ8VBT2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SdsQ8VBT2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SdsQ8VBT2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SdsQ8VBT2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SdsQ8VBT2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SdsQ8VBT2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SdsQ8VBT2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SdsQ8VBT2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SdsQ8VBT2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SdsQ8VBT2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SdsQ8VBT2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SdsQ8VBT2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SdsQ8VBT2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SdsQ8VBT2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SdsQ8VBT2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SdsQ8VBT2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SdsQ8VBT2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SdsQ8VBT2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SdsQ8VBT2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SdsQ8VBT2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SdsQ8VBT2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SdsQ8VBT2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SdsQ8VBT2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SdsQ8VBT2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SdsQ8VBT2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SdsQ8VBT2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SdsQ8VBT2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SdsQ8VBT2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SdsQ8VBT2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SdsQ8VBT2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SdsQ8VBT2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SdsQ8VBT2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SdsQ8VBT2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SdsQ8VBT2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SdsQ8VBT2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SdsQ8VBT2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SdsQ8VBT2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SdsQ8VBT2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SdsQ8VBT2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SdsQ8VBT2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SdsQ8VBT2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SdsQ8VBT2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SdsQ8VBT2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SdsQ8VBT2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SdsQ8VBT2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SdsQ8VBT2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SdsQ8VBT2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SdsQ8VBT2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SdsQ8VBT2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SdsQ8VBT2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SdsQ8VBT2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SdsQ8VBT2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SdsQ8VBT2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SdsQ8VBT2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SdsQ8VBT2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SdsQ8VBT2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SdsQ8VBT2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SdsQ8VBT2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SdsQ8VBT2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SdsQ8VBT2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SdsQ8VBT2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SdsQ8VBT2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SdsQ8VBT2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SdsQ8VBT2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SdsQ8VBT2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SdsQ8VBT2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SdsQ8VBT2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SdsQ8VBT2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SdsQ8VBT2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SdsQ8VBT2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SdsQ8VBT2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SdsQ8VBT2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SdsQ8VBT2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SdsQ8VBT2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SdsQ8VBT2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SdsQ8VBT2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SdsQ8VBT2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SdsQ8VBT2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SdsQ8VBT2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SdsQ8VBT2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SdsQ8VBT2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SdsQ8VBT2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SdsQ8VBT2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SdsQ8VBT2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SdsQ8VBT2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms