Protein–RNA interactions for Protein: Q8R574

Prpsap2, Phosphoribosyl pyrophosphate synthase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpsap2Q8R574 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpsap2Q8R574 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpsap2Q8R574 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpsap2Q8R574 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpsap2Q8R574 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpsap2Q8R574 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpsap2Q8R574 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prpsap2Q8R574 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prpsap2Q8R574 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Prpsap2Q8R574 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prpsap2Q8R574 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Prpsap2Q8R574 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpsap2Q8R574 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpsap2Q8R574 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpsap2Q8R574 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpsap2Q8R574 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpsap2Q8R574 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpsap2Q8R574 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpsap2Q8R574 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpsap2Q8R574 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpsap2Q8R574 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpsap2Q8R574 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpsap2Q8R574 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpsap2Q8R574 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpsap2Q8R574 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prpsap2Q8R574 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prpsap2Q8R574 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prpsap2Q8R574 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prpsap2Q8R574 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prpsap2Q8R574 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prpsap2Q8R574 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prpsap2Q8R574 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prpsap2Q8R574 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prpsap2Q8R574 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpsap2Q8R574 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpsap2Q8R574 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpsap2Q8R574 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpsap2Q8R574 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpsap2Q8R574 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpsap2Q8R574 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpsap2Q8R574 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpsap2Q8R574 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpsap2Q8R574 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpsap2Q8R574 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpsap2Q8R574 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpsap2Q8R574 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpsap2Q8R574 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpsap2Q8R574 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpsap2Q8R574 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpsap2Q8R574 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpsap2Q8R574 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpsap2Q8R574 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpsap2Q8R574 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpsap2Q8R574 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpsap2Q8R574 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpsap2Q8R574 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpsap2Q8R574 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prpsap2Q8R574 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prpsap2Q8R574 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prpsap2Q8R574 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prpsap2Q8R574 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prpsap2Q8R574 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prpsap2Q8R574 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prpsap2Q8R574 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prpsap2Q8R574 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Prpsap2Q8R574 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prpsap2Q8R574 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prpsap2Q8R574 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prpsap2Q8R574 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prpsap2Q8R574 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpsap2Q8R574 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpsap2Q8R574 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpsap2Q8R574 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpsap2Q8R574 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Prpsap2Q8R574 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prpsap2Q8R574 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prpsap2Q8R574 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prpsap2Q8R574 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prpsap2Q8R574 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prpsap2Q8R574 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prpsap2Q8R574 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prpsap2Q8R574 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prpsap2Q8R574 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prpsap2Q8R574 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prpsap2Q8R574 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prpsap2Q8R574 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prpsap2Q8R574 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prpsap2Q8R574 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prpsap2Q8R574 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prpsap2Q8R574 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prpsap2Q8R574 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpsap2Q8R574 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpsap2Q8R574 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpsap2Q8R574 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpsap2Q8R574 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpsap2Q8R574 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpsap2Q8R574 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpsap2Q8R574 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prpsap2Q8R574 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prpsap2Q8R574 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms