Protein–RNA interactions for Protein: Q8R420

Abca3, ATP-binding cassette sub-family A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abca3Q8R420 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Abca3Q8R420 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Abca3Q8R420 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Abca3Q8R420 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Abca3Q8R420 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Abca3Q8R420 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Abca3Q8R420 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Abca3Q8R420 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Abca3Q8R420 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Abca3Q8R420 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Abca3Q8R420 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Abca3Q8R420 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Abca3Q8R420 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Abca3Q8R420 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Abca3Q8R420 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Abca3Q8R420 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Abca3Q8R420 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Abca3Q8R420 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Abca3Q8R420 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Abca3Q8R420 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Abca3Q8R420 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Abca3Q8R420 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Abca3Q8R420 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Abca3Q8R420 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Abca3Q8R420 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Abca3Q8R420 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Abca3Q8R420 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Abca3Q8R420 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Abca3Q8R420 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Abca3Q8R420 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Abca3Q8R420 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Abca3Q8R420 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Abca3Q8R420 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Abca3Q8R420 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Abca3Q8R420 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Abca3Q8R420 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Abca3Q8R420 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Abca3Q8R420 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Abca3Q8R420 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Abca3Q8R420 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Abca3Q8R420 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Abca3Q8R420 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Abca3Q8R420 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Abca3Q8R420 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Abca3Q8R420 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Abca3Q8R420 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Abca3Q8R420 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Abca3Q8R420 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Abca3Q8R420 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Abca3Q8R420 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Abca3Q8R420 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Abca3Q8R420 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Abca3Q8R420 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Abca3Q8R420 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Abca3Q8R420 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Abca3Q8R420 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Abca3Q8R420 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Abca3Q8R420 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Abca3Q8R420 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Abca3Q8R420 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Abca3Q8R420 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Abca3Q8R420 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Abca3Q8R420 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Abca3Q8R420 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Abca3Q8R420 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Abca3Q8R420 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Abca3Q8R420 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Abca3Q8R420 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Abca3Q8R420 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Abca3Q8R420 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Abca3Q8R420 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Abca3Q8R420 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Abca3Q8R420 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Abca3Q8R420 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Abca3Q8R420 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Abca3Q8R420 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Abca3Q8R420 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Abca3Q8R420 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Abca3Q8R420 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Abca3Q8R420 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Abca3Q8R420 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Abca3Q8R420 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Abca3Q8R420 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Abca3Q8R420 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Abca3Q8R420 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Abca3Q8R420 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Abca3Q8R420 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Abca3Q8R420 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Abca3Q8R420 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Abca3Q8R420 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Abca3Q8R420 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Abca3Q8R420 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Abca3Q8R420 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Abca3Q8R420 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Abca3Q8R420 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Abca3Q8R420 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Abca3Q8R420 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Abca3Q8R420 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Abca3Q8R420 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Abca3Q8R420 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms