Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3W2

0610009B22Rik, MCG6979, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
0610009B22RikQ8R3W2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
0610009B22RikQ8R3W2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
0610009B22RikQ8R3W2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
0610009B22RikQ8R3W2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
0610009B22RikQ8R3W2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
0610009B22RikQ8R3W2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
0610009B22RikQ8R3W2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
0610009B22RikQ8R3W2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
0610009B22RikQ8R3W2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
0610009B22RikQ8R3W2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
0610009B22RikQ8R3W2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
0610009B22RikQ8R3W2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
0610009B22RikQ8R3W2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
0610009B22RikQ8R3W2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
0610009B22RikQ8R3W2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
0610009B22RikQ8R3W2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
0610009B22RikQ8R3W2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
0610009B22RikQ8R3W2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
0610009B22RikQ8R3W2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
0610009B22RikQ8R3W2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
0610009B22RikQ8R3W2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
0610009B22RikQ8R3W2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
0610009B22RikQ8R3W2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
0610009B22RikQ8R3W2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
0610009B22RikQ8R3W2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
0610009B22RikQ8R3W2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
0610009B22RikQ8R3W2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
0610009B22RikQ8R3W2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
0610009B22RikQ8R3W2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
0610009B22RikQ8R3W2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
0610009B22RikQ8R3W2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
0610009B22RikQ8R3W2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
0610009B22RikQ8R3W2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
0610009B22RikQ8R3W2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
0610009B22RikQ8R3W2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
0610009B22RikQ8R3W2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
0610009B22RikQ8R3W2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
0610009B22RikQ8R3W2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
0610009B22RikQ8R3W2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
0610009B22RikQ8R3W2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
0610009B22RikQ8R3W2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
0610009B22RikQ8R3W2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
0610009B22RikQ8R3W2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
0610009B22RikQ8R3W2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
0610009B22RikQ8R3W2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
0610009B22RikQ8R3W2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
0610009B22RikQ8R3W2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
0610009B22RikQ8R3W2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
0610009B22RikQ8R3W2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
0610009B22RikQ8R3W2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
0610009B22RikQ8R3W2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
0610009B22RikQ8R3W2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
0610009B22RikQ8R3W2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
0610009B22RikQ8R3W2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
0610009B22RikQ8R3W2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
0610009B22RikQ8R3W2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
0610009B22RikQ8R3W2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
0610009B22RikQ8R3W2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
0610009B22RikQ8R3W2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
0610009B22RikQ8R3W2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
0610009B22RikQ8R3W2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
0610009B22RikQ8R3W2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
0610009B22RikQ8R3W2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
0610009B22RikQ8R3W2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
0610009B22RikQ8R3W2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
0610009B22RikQ8R3W2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
0610009B22RikQ8R3W2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
0610009B22RikQ8R3W2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
0610009B22RikQ8R3W2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
0610009B22RikQ8R3W2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
0610009B22RikQ8R3W2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
0610009B22RikQ8R3W2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
0610009B22RikQ8R3W2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
0610009B22RikQ8R3W2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
0610009B22RikQ8R3W2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
0610009B22RikQ8R3W2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
0610009B22RikQ8R3W2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
0610009B22RikQ8R3W2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
0610009B22RikQ8R3W2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
0610009B22RikQ8R3W2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
0610009B22RikQ8R3W2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
0610009B22RikQ8R3W2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
0610009B22RikQ8R3W2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
0610009B22RikQ8R3W2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
0610009B22RikQ8R3W2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
0610009B22RikQ8R3W2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
0610009B22RikQ8R3W2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
0610009B22RikQ8R3W2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
0610009B22RikQ8R3W2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
0610009B22RikQ8R3W2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
0610009B22RikQ8R3W2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
0610009B22RikQ8R3W2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
0610009B22RikQ8R3W2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
0610009B22RikQ8R3W2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
0610009B22RikQ8R3W2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
0610009B22RikQ8R3W2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
0610009B22RikQ8R3W2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
0610009B22RikQ8R3W2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
0610009B22RikQ8R3W2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
0610009B22RikQ8R3W2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms