Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim29Q8R2Q0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim29Q8R2Q0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim29Q8R2Q0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim29Q8R2Q0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim29Q8R2Q0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim29Q8R2Q0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim29Q8R2Q0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim29Q8R2Q0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim29Q8R2Q0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim29Q8R2Q0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim29Q8R2Q0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim29Q8R2Q0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim29Q8R2Q0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim29Q8R2Q0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim29Q8R2Q0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim29Q8R2Q0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim29Q8R2Q0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim29Q8R2Q0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim29Q8R2Q0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim29Q8R2Q0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim29Q8R2Q0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim29Q8R2Q0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim29Q8R2Q0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim29Q8R2Q0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim29Q8R2Q0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim29Q8R2Q0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim29Q8R2Q0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim29Q8R2Q0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim29Q8R2Q0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim29Q8R2Q0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim29Q8R2Q0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim29Q8R2Q0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim29Q8R2Q0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim29Q8R2Q0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim29Q8R2Q0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim29Q8R2Q0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim29Q8R2Q0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim29Q8R2Q0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim29Q8R2Q0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim29Q8R2Q0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim29Q8R2Q0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim29Q8R2Q0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim29Q8R2Q0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim29Q8R2Q0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim29Q8R2Q0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim29Q8R2Q0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim29Q8R2Q0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim29Q8R2Q0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim29Q8R2Q0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim29Q8R2Q0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim29Q8R2Q0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim29Q8R2Q0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim29Q8R2Q0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim29Q8R2Q0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim29Q8R2Q0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim29Q8R2Q0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim29Q8R2Q0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim29Q8R2Q0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim29Q8R2Q0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim29Q8R2Q0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim29Q8R2Q0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim29Q8R2Q0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trim29Q8R2Q0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trim29Q8R2Q0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trim29Q8R2Q0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim29Q8R2Q0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim29Q8R2Q0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim29Q8R2Q0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim29Q8R2Q0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim29Q8R2Q0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim29Q8R2Q0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim29Q8R2Q0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim29Q8R2Q0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim29Q8R2Q0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim29Q8R2Q0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim29Q8R2Q0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim29Q8R2Q0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim29Q8R2Q0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim29Q8R2Q0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim29Q8R2Q0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim29Q8R2Q0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim29Q8R2Q0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim29Q8R2Q0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim29Q8R2Q0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim29Q8R2Q0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim29Q8R2Q0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim29Q8R2Q0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim29Q8R2Q0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim29Q8R2Q0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim29Q8R2Q0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim29Q8R2Q0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim29Q8R2Q0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim29Q8R2Q0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim29Q8R2Q0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim29Q8R2Q0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim29Q8R2Q0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim29Q8R2Q0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim29Q8R2Q0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim29Q8R2Q0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms