Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X3

Stn1, CST complex subunit STN1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stn1Q8K2X3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Stn1Q8K2X3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Stn1Q8K2X3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Stn1Q8K2X3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Stn1Q8K2X3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Stn1Q8K2X3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Stn1Q8K2X3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Stn1Q8K2X3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Stn1Q8K2X3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Stn1Q8K2X3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Stn1Q8K2X3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Stn1Q8K2X3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Stn1Q8K2X3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Stn1Q8K2X3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Stn1Q8K2X3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Stn1Q8K2X3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Stn1Q8K2X3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Stn1Q8K2X3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Stn1Q8K2X3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Stn1Q8K2X3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Stn1Q8K2X3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Stn1Q8K2X3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Stn1Q8K2X3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Stn1Q8K2X3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Stn1Q8K2X3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Stn1Q8K2X3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Stn1Q8K2X3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Stn1Q8K2X3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Stn1Q8K2X3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Stn1Q8K2X3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Stn1Q8K2X3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Stn1Q8K2X3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Stn1Q8K2X3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Stn1Q8K2X3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Stn1Q8K2X3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Stn1Q8K2X3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Stn1Q8K2X3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Stn1Q8K2X3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Stn1Q8K2X3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Stn1Q8K2X3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Stn1Q8K2X3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Stn1Q8K2X3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Stn1Q8K2X3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Stn1Q8K2X3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Stn1Q8K2X3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Stn1Q8K2X3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Stn1Q8K2X3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Stn1Q8K2X3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Stn1Q8K2X3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Stn1Q8K2X3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Stn1Q8K2X3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Stn1Q8K2X3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Stn1Q8K2X3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Stn1Q8K2X3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Stn1Q8K2X3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Stn1Q8K2X3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Stn1Q8K2X3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Stn1Q8K2X3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Stn1Q8K2X3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Stn1Q8K2X3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Stn1Q8K2X3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Stn1Q8K2X3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Stn1Q8K2X3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Stn1Q8K2X3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Stn1Q8K2X3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Stn1Q8K2X3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Stn1Q8K2X3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Stn1Q8K2X3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Stn1Q8K2X3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Stn1Q8K2X3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Stn1Q8K2X3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Stn1Q8K2X3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Stn1Q8K2X3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Stn1Q8K2X3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Stn1Q8K2X3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Stn1Q8K2X3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Stn1Q8K2X3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Stn1Q8K2X3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Stn1Q8K2X3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Stn1Q8K2X3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Stn1Q8K2X3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Stn1Q8K2X3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Stn1Q8K2X3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Stn1Q8K2X3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Stn1Q8K2X3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Stn1Q8K2X3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Stn1Q8K2X3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Stn1Q8K2X3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Stn1Q8K2X3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Stn1Q8K2X3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Stn1Q8K2X3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Stn1Q8K2X3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Stn1Q8K2X3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Stn1Q8K2X3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Stn1Q8K2X3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Stn1Q8K2X3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Stn1Q8K2X3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Stn1Q8K2X3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Stn1Q8K2X3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Stn1Q8K2X3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms