Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nek9Q8K1R7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nek9Q8K1R7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nek9Q8K1R7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nek9Q8K1R7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Nek9Q8K1R7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nek9Q8K1R7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nek9Q8K1R7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nek9Q8K1R7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nek9Q8K1R7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Nek9Q8K1R7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nek9Q8K1R7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Nek9Q8K1R7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nek9Q8K1R7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nek9Q8K1R7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nek9Q8K1R7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nek9Q8K1R7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Nek9Q8K1R7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nek9Q8K1R7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nek9Q8K1R7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nek9Q8K1R7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nek9Q8K1R7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nek9Q8K1R7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nek9Q8K1R7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nek9Q8K1R7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nek9Q8K1R7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nek9Q8K1R7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nek9Q8K1R7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nek9Q8K1R7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nek9Q8K1R7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nek9Q8K1R7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nek9Q8K1R7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nek9Q8K1R7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nek9Q8K1R7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nek9Q8K1R7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Nek9Q8K1R7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nek9Q8K1R7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nek9Q8K1R7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nek9Q8K1R7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nek9Q8K1R7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nek9Q8K1R7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nek9Q8K1R7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nek9Q8K1R7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nek9Q8K1R7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nek9Q8K1R7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nek9Q8K1R7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nek9Q8K1R7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Nek9Q8K1R7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nek9Q8K1R7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nek9Q8K1R7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nek9Q8K1R7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nek9Q8K1R7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nek9Q8K1R7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nek9Q8K1R7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nek9Q8K1R7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nek9Q8K1R7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nek9Q8K1R7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nek9Q8K1R7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nek9Q8K1R7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nek9Q8K1R7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nek9Q8K1R7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nek9Q8K1R7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nek9Q8K1R7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nek9Q8K1R7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nek9Q8K1R7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nek9Q8K1R7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Nek9Q8K1R7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nek9Q8K1R7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nek9Q8K1R7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nek9Q8K1R7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nek9Q8K1R7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nek9Q8K1R7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nek9Q8K1R7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nek9Q8K1R7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nek9Q8K1R7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nek9Q8K1R7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Nek9Q8K1R7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Nek9Q8K1R7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nek9Q8K1R7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nek9Q8K1R7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nek9Q8K1R7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nek9Q8K1R7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nek9Q8K1R7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nek9Q8K1R7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nek9Q8K1R7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nek9Q8K1R7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nek9Q8K1R7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nek9Q8K1R7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nek9Q8K1R7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nek9Q8K1R7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nek9Q8K1R7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nek9Q8K1R7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nek9Q8K1R7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nek9Q8K1R7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nek9Q8K1R7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nek9Q8K1R7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nek9Q8K1R7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nek9Q8K1R7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nek9Q8K1R7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nek9Q8K1R7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms