Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rasgef1bQ8JZL7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Rasgef1bQ8JZL7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rasgef1bQ8JZL7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rasgef1bQ8JZL7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rasgef1bQ8JZL7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rasgef1bQ8JZL7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rasgef1bQ8JZL7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rasgef1bQ8JZL7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rasgef1bQ8JZL7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rasgef1bQ8JZL7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rasgef1bQ8JZL7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rasgef1bQ8JZL7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rasgef1bQ8JZL7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rasgef1bQ8JZL7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rasgef1bQ8JZL7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rasgef1bQ8JZL7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rasgef1bQ8JZL7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rasgef1bQ8JZL7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rasgef1bQ8JZL7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rasgef1bQ8JZL7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rasgef1bQ8JZL7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rasgef1bQ8JZL7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rasgef1bQ8JZL7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rasgef1bQ8JZL7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rasgef1bQ8JZL7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rasgef1bQ8JZL7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rasgef1bQ8JZL7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rasgef1bQ8JZL7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rasgef1bQ8JZL7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rasgef1bQ8JZL7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rasgef1bQ8JZL7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rasgef1bQ8JZL7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rasgef1bQ8JZL7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rasgef1bQ8JZL7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rasgef1bQ8JZL7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rasgef1bQ8JZL7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rasgef1bQ8JZL7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rasgef1bQ8JZL7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rasgef1bQ8JZL7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rasgef1bQ8JZL7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rasgef1bQ8JZL7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rasgef1bQ8JZL7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rasgef1bQ8JZL7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rasgef1bQ8JZL7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rasgef1bQ8JZL7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rasgef1bQ8JZL7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Rasgef1bQ8JZL7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rasgef1bQ8JZL7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rasgef1bQ8JZL7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rasgef1bQ8JZL7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rasgef1bQ8JZL7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rasgef1bQ8JZL7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rasgef1bQ8JZL7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rasgef1bQ8JZL7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rasgef1bQ8JZL7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rasgef1bQ8JZL7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rasgef1bQ8JZL7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rasgef1bQ8JZL7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rasgef1bQ8JZL7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rasgef1bQ8JZL7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rasgef1bQ8JZL7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rasgef1bQ8JZL7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rasgef1bQ8JZL7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Rasgef1bQ8JZL7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rasgef1bQ8JZL7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rasgef1bQ8JZL7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rasgef1bQ8JZL7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rasgef1bQ8JZL7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rasgef1bQ8JZL7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rasgef1bQ8JZL7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rasgef1bQ8JZL7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rasgef1bQ8JZL7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rasgef1bQ8JZL7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rasgef1bQ8JZL7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rasgef1bQ8JZL7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rasgef1bQ8JZL7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rasgef1bQ8JZL7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rasgef1bQ8JZL7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rasgef1bQ8JZL7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rasgef1bQ8JZL7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rasgef1bQ8JZL7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rasgef1bQ8JZL7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rasgef1bQ8JZL7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rasgef1bQ8JZL7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rasgef1bQ8JZL7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rasgef1bQ8JZL7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rasgef1bQ8JZL7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rasgef1bQ8JZL7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rasgef1bQ8JZL7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rasgef1bQ8JZL7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rasgef1bQ8JZL7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rasgef1bQ8JZL7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rasgef1bQ8JZL7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rasgef1bQ8JZL7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rasgef1bQ8JZL7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rasgef1bQ8JZL7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102 ms