Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJF8

Ago4, Protein argonaute-4, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ago4Q8CJF8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ago4Q8CJF8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ago4Q8CJF8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ago4Q8CJF8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ago4Q8CJF8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ago4Q8CJF8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ago4Q8CJF8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ago4Q8CJF8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ago4Q8CJF8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ago4Q8CJF8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ago4Q8CJF8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ago4Q8CJF8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ago4Q8CJF8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ago4Q8CJF8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ago4Q8CJF8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ago4Q8CJF8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ago4Q8CJF8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ago4Q8CJF8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ago4Q8CJF8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ago4Q8CJF8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ago4Q8CJF8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ago4Q8CJF8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ago4Q8CJF8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ago4Q8CJF8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ago4Q8CJF8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ago4Q8CJF8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ago4Q8CJF8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ago4Q8CJF8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ago4Q8CJF8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ago4Q8CJF8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ago4Q8CJF8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ago4Q8CJF8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ago4Q8CJF8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ago4Q8CJF8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ago4Q8CJF8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ago4Q8CJF8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ago4Q8CJF8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ago4Q8CJF8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ago4Q8CJF8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ago4Q8CJF8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ago4Q8CJF8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ago4Q8CJF8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ago4Q8CJF8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ago4Q8CJF8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ago4Q8CJF8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ago4Q8CJF8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ago4Q8CJF8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ago4Q8CJF8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ago4Q8CJF8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ago4Q8CJF8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ago4Q8CJF8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ago4Q8CJF8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ago4Q8CJF8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ago4Q8CJF8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ago4Q8CJF8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ago4Q8CJF8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ago4Q8CJF8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ago4Q8CJF8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ago4Q8CJF8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ago4Q8CJF8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ago4Q8CJF8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ago4Q8CJF8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ago4Q8CJF8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ago4Q8CJF8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ago4Q8CJF8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ago4Q8CJF8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ago4Q8CJF8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ago4Q8CJF8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ago4Q8CJF8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ago4Q8CJF8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ago4Q8CJF8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ago4Q8CJF8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ago4Q8CJF8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ago4Q8CJF8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ago4Q8CJF8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ago4Q8CJF8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ago4Q8CJF8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ago4Q8CJF8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ago4Q8CJF8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ago4Q8CJF8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ago4Q8CJF8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ago4Q8CJF8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ago4Q8CJF8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ago4Q8CJF8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ago4Q8CJF8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ago4Q8CJF8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ago4Q8CJF8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ago4Q8CJF8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ago4Q8CJF8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ago4Q8CJF8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ago4Q8CJF8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ago4Q8CJF8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ago4Q8CJF8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ago4Q8CJF8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ago4Q8CJF8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ago4Q8CJF8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ago4Q8CJF8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ago4Q8CJF8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ago4Q8CJF8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ago4Q8CJF8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms