Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SbsnQ8CIT9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SbsnQ8CIT9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SbsnQ8CIT9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SbsnQ8CIT9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SbsnQ8CIT9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SbsnQ8CIT9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SbsnQ8CIT9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SbsnQ8CIT9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SbsnQ8CIT9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SbsnQ8CIT9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SbsnQ8CIT9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SbsnQ8CIT9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SbsnQ8CIT9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SbsnQ8CIT9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SbsnQ8CIT9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SbsnQ8CIT9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SbsnQ8CIT9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SbsnQ8CIT9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SbsnQ8CIT9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SbsnQ8CIT9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SbsnQ8CIT9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SbsnQ8CIT9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SbsnQ8CIT9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SbsnQ8CIT9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SbsnQ8CIT9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SbsnQ8CIT9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SbsnQ8CIT9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SbsnQ8CIT9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SbsnQ8CIT9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SbsnQ8CIT9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SbsnQ8CIT9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SbsnQ8CIT9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SbsnQ8CIT9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SbsnQ8CIT9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SbsnQ8CIT9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SbsnQ8CIT9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SbsnQ8CIT9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SbsnQ8CIT9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SbsnQ8CIT9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SbsnQ8CIT9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SbsnQ8CIT9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SbsnQ8CIT9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SbsnQ8CIT9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SbsnQ8CIT9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SbsnQ8CIT9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SbsnQ8CIT9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SbsnQ8CIT9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SbsnQ8CIT9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SbsnQ8CIT9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SbsnQ8CIT9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SbsnQ8CIT9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SbsnQ8CIT9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SbsnQ8CIT9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SbsnQ8CIT9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SbsnQ8CIT9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SbsnQ8CIT9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SbsnQ8CIT9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SbsnQ8CIT9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SbsnQ8CIT9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SbsnQ8CIT9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SbsnQ8CIT9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SbsnQ8CIT9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SbsnQ8CIT9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SbsnQ8CIT9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SbsnQ8CIT9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SbsnQ8CIT9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SbsnQ8CIT9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SbsnQ8CIT9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SbsnQ8CIT9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SbsnQ8CIT9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SbsnQ8CIT9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SbsnQ8CIT9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SbsnQ8CIT9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SbsnQ8CIT9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SbsnQ8CIT9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SbsnQ8CIT9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SbsnQ8CIT9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SbsnQ8CIT9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SbsnQ8CIT9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SbsnQ8CIT9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SbsnQ8CIT9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SbsnQ8CIT9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SbsnQ8CIT9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SbsnQ8CIT9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SbsnQ8CIT9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SbsnQ8CIT9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SbsnQ8CIT9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SbsnQ8CIT9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SbsnQ8CIT9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SbsnQ8CIT9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SbsnQ8CIT9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SbsnQ8CIT9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SbsnQ8CIT9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SbsnQ8CIT9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SbsnQ8CIT9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SbsnQ8CIT9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SbsnQ8CIT9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SbsnQ8CIT9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SbsnQ8CIT9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms