Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIF6

Sidt2, SID1 transmembrane family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 832 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sidt2Q8CIF6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sidt2Q8CIF6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sidt2Q8CIF6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sidt2Q8CIF6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sidt2Q8CIF6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sidt2Q8CIF6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sidt2Q8CIF6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sidt2Q8CIF6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sidt2Q8CIF6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sidt2Q8CIF6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sidt2Q8CIF6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sidt2Q8CIF6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sidt2Q8CIF6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Sidt2Q8CIF6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sidt2Q8CIF6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sidt2Q8CIF6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sidt2Q8CIF6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sidt2Q8CIF6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sidt2Q8CIF6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sidt2Q8CIF6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sidt2Q8CIF6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sidt2Q8CIF6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sidt2Q8CIF6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sidt2Q8CIF6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sidt2Q8CIF6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sidt2Q8CIF6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sidt2Q8CIF6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sidt2Q8CIF6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sidt2Q8CIF6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sidt2Q8CIF6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sidt2Q8CIF6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sidt2Q8CIF6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sidt2Q8CIF6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sidt2Q8CIF6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sidt2Q8CIF6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sidt2Q8CIF6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sidt2Q8CIF6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sidt2Q8CIF6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sidt2Q8CIF6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sidt2Q8CIF6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sidt2Q8CIF6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sidt2Q8CIF6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sidt2Q8CIF6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sidt2Q8CIF6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sidt2Q8CIF6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sidt2Q8CIF6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sidt2Q8CIF6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sidt2Q8CIF6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sidt2Q8CIF6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sidt2Q8CIF6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sidt2Q8CIF6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sidt2Q8CIF6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sidt2Q8CIF6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sidt2Q8CIF6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sidt2Q8CIF6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sidt2Q8CIF6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sidt2Q8CIF6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sidt2Q8CIF6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sidt2Q8CIF6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sidt2Q8CIF6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sidt2Q8CIF6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sidt2Q8CIF6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sidt2Q8CIF6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sidt2Q8CIF6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sidt2Q8CIF6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sidt2Q8CIF6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sidt2Q8CIF6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sidt2Q8CIF6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sidt2Q8CIF6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sidt2Q8CIF6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sidt2Q8CIF6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Sidt2Q8CIF6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Sidt2Q8CIF6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sidt2Q8CIF6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sidt2Q8CIF6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sidt2Q8CIF6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sidt2Q8CIF6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sidt2Q8CIF6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sidt2Q8CIF6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sidt2Q8CIF6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sidt2Q8CIF6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sidt2Q8CIF6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sidt2Q8CIF6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sidt2Q8CIF6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sidt2Q8CIF6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sidt2Q8CIF6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sidt2Q8CIF6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sidt2Q8CIF6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sidt2Q8CIF6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Sidt2Q8CIF6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sidt2Q8CIF6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sidt2Q8CIF6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sidt2Q8CIF6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sidt2Q8CIF6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sidt2Q8CIF6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sidt2Q8CIF6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sidt2Q8CIF6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sidt2Q8CIF6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sidt2Q8CIF6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sidt2Q8CIF6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms