Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Upp2Q8CGR7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Upp2Q8CGR7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Upp2Q8CGR7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Upp2Q8CGR7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Upp2Q8CGR7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Upp2Q8CGR7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Upp2Q8CGR7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Upp2Q8CGR7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Upp2Q8CGR7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Upp2Q8CGR7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
Upp2Q8CGR7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Upp2Q8CGR7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Upp2Q8CGR7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Upp2Q8CGR7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Upp2Q8CGR7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Upp2Q8CGR7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Upp2Q8CGR7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Upp2Q8CGR7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Upp2Q8CGR7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Upp2Q8CGR7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Upp2Q8CGR7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Upp2Q8CGR7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Upp2Q8CGR7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Upp2Q8CGR7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Upp2Q8CGR7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Upp2Q8CGR7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Upp2Q8CGR7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Upp2Q8CGR7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Upp2Q8CGR7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Upp2Q8CGR7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Upp2Q8CGR7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Upp2Q8CGR7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Upp2Q8CGR7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Upp2Q8CGR7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Upp2Q8CGR7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Upp2Q8CGR7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Upp2Q8CGR7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Upp2Q8CGR7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Upp2Q8CGR7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Upp2Q8CGR7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Upp2Q8CGR7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Upp2Q8CGR7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Upp2Q8CGR7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Upp2Q8CGR7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Upp2Q8CGR7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Upp2Q8CGR7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Upp2Q8CGR7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Upp2Q8CGR7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Upp2Q8CGR7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Upp2Q8CGR7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Upp2Q8CGR7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Upp2Q8CGR7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Upp2Q8CGR7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Upp2Q8CGR7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Upp2Q8CGR7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Upp2Q8CGR7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Upp2Q8CGR7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Upp2Q8CGR7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Upp2Q8CGR7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Upp2Q8CGR7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Upp2Q8CGR7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Upp2Q8CGR7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Upp2Q8CGR7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Upp2Q8CGR7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Upp2Q8CGR7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Upp2Q8CGR7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Upp2Q8CGR7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Upp2Q8CGR7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Upp2Q8CGR7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Upp2Q8CGR7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Upp2Q8CGR7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Upp2Q8CGR7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Upp2Q8CGR7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Upp2Q8CGR7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Upp2Q8CGR7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Upp2Q8CGR7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Upp2Q8CGR7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Upp2Q8CGR7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Upp2Q8CGR7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Upp2Q8CGR7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Upp2Q8CGR7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Upp2Q8CGR7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Upp2Q8CGR7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Upp2Q8CGR7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Upp2Q8CGR7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Upp2Q8CGR7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Upp2Q8CGR7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Upp2Q8CGR7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Upp2Q8CGR7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Upp2Q8CGR7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Upp2Q8CGR7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Upp2Q8CGR7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Upp2Q8CGR7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Upp2Q8CGR7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Upp2Q8CGR7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Upp2Q8CGR7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Upp2Q8CGR7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Upp2Q8CGR7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Upp2Q8CGR7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms